CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

نقش ایمپیوتیشن ژنوتیپ و معماری های مختلف ژنومی بر عملکرد روش های جنگل تصادفی و بیز آستانه ای A

عنوان مقاله: نقش ایمپیوتیشن ژنوتیپ و معماری های مختلف ژنومی بر عملکرد روش های جنگل تصادفی و بیز آستانه ای A
شناسه ملی مقاله: PDCONF06_106
منتشر شده در ششمین کنگره علمی پژوهشی توسعه و ترویج علوم کشاورزی و منابع طبیعی در ایران در سال 1397
مشخصات نویسندگان مقاله:

یوسف نادری - استادیار گروه علوم دامی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد آستارا، آستارا، ایران
محمد مزارعی - دانشجوی کارشناسی ارشد علوم دامی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد آستارا، آستارا، ایران

خلاصه مقاله:
هدف این تحقیق بررسی صحت ایمپیوتیشن و تاثیر آن در سطح زیر منحنی مشخصه عملکرد (AUROC) ارزیابی ژنومی روش های بیز استانهای TBA ) A ) و جنگل تصادفی (RF) در صفات آستانه ای با معماری های مختلف ژنومی می باشد. داده های ژنومی برای سطوح متفاوت وراثت پذیری (0 / 1 و 0 / 3)، سطوح مختلف LD ( 0 / 135 و 0 / 295) و تعداد متفاوت جایگاههای صفات کمی (108 و 1080) بر روی کروموزم 27 کروموزم شبیه سازی شدند. برای شبیه سازی شرایط واقعی برای هر سناریو، از بین 54 هزار نشانگر شبیه سازی شده به طور تصادفی اقدام به حذف ٪50 و 90 نشانگرها نموده و در مرحله بعد از طریق ایمپیوتیشن اقدام به پیش بینی ژنوتیپ نشانگرها نموده و صحت ایمپیوتیشن مورد ارزیابی قرار گرفت. در گام آخر، ژنوتیپهای اصلی و ایمپیوت شده با استفاده از روش TBA و RF جهت ارزیابی AUROC مورد استفاده قرار گرفتند. با افزایش سطح LD و کاهش نرخ حذف نشانگرها، صحت ایمبیوتیشن بهبود یافت.

کلمات کلیدی:
عدم تعادل پیوستگی، نرخ ژنوتیپ از دست رفته، شبیه سازی

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/911198/