CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)

بررسی اثر متقابل ژنوتیپ و محیط با جانهی داده ژنومی شبیه سازی شده

عنوان مقاله: بررسی اثر متقابل ژنوتیپ و محیط با جانهی داده ژنومی شبیه سازی شده
شناسه ملی مقاله: PDCONF06_107
منتشر شده در ششمین کنگره علمی پژوهشی توسعه و ترویج علوم کشاورزی و منابع طبیعی در ایران در سال 1397
مشخصات نویسندگان مقاله:

یوسف نادری - استادیار گروه علوم دامی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد آستارا، آستارا، ایران
محمد مزارعی - دانشجوی کارشناسی ارشد علوم دامی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد آستارا، آستارا، ایران

خلاصه مقاله:
هدف از این تحقیق ارزیابی مدل های تک صفتی و چندصفتی در سناریوهای مختلف ژنومی با در نظر گرفتن جانهی جهت برآورد صحت پیش بینی ژنومی و تشخیص وجود اثر متقابل ژنوتیپ و محیط (G XE) بود. داده های ژنومی با تعداد متفاوت جایگاههای صفات کمی (90 و 900) و سطوح مختلف عدم تعادل پیوستگی (کم و زیاد = LD) برای تراکم 50 شبیه سازی شدند. سپس به طور تصادفی 90 درصد نشانگرها حذف و در مرحله بعد این نشانگرها از طریق نرم افزار FImpute (نسخه 2 / 2) جانهی شدند. میانگین صحت جانی در سناریوهای با LD زیاد و کم به ترتیب 0 / 976 و 943/. بود. در همه سناریوهای شبیه سازی شده تفاوت جزئی بین صحت ژنومی داده های اصلی و جانی مشاهده شد. صحت ژنومی با کاهش سطح LD وراثت پذیری و همبستگی ژنتیکی بین صفات کاهش یافت.

کلمات کلیدی:
صحت جانبی، صحت ژنومی، عدم تعادل پیوستگی، مدل حیوانی چندصفتی

صفحه اختصاصی مقاله و دریافت فایل کامل: https://civilica.com/doc/911199/