ناشر تخصصی کنفرانس های ایران

لطفا کمی صبر نمایید

Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings
Login |Register |Help |عضویت کتابخانه ها
Paper
Title

غربالگری توالی های ثبت شده از نواحی بیان شونده ژنوم پرتقال برای تشخیص نشانگرهای مبتنی بر میکروساتلایت

Year: 1398
COI: BAGHBANI11_619
Language: PersianView: 154
This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download

Buy and Download

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این Paper را که دارای 5 صفحه است به صورت فایل PDF در اختیار داشته باشید.
آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:

Authors

عبدالکریم زارعی - گروه بیوتکنولوژی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه جهرم، جهرم
عزیز ابراهیمی - گروه جنگلداری و منابع طبیعی، دانشگاه پوردو، وست لافایت، ایالات متحده آمریکا

Abstract:

به منظور شناسایی و تعیین ویژگی انواع توالی های تکراری و توسعه نشانگرهای میکروساتلیتی مبتنی بر آنها، در پژوهش حاضر توالی های رونوشت ثبت شده در بانک داده های اسید نوکلئیک گیاه پرتقال (Citrus sinensis) مورد غربالگری و آنالیز قرار گرفت. بطور کلی 214598 توالی رونوشت مربوط به پرتقال از بانک اطلاعاتی NCBI استخراج و مورد آنالیز قرار گرفت که از بین آنها 5475 عدد حداقل دارای یک ناحیه میکروساتلیتی بودند (بطور میانگین 2/5 درصد از توالی های ثبت شده). درمجموع 5632 توالی تکراری در بین توالیهای بررسی شده وجود داشت که 118 عدد از آنها از نوع توالیهای مرکب بودند. از بین توالیهای مورد آنالیز 3097 عدد دارای مناطق احاطه کننده مناسب بوده و قابلیت تبدیل شدن به نشانگرهای میکروساتلیتی را دارا بودند. نتایج تجزیه توالیهای بررسی شده نشان داد که به ترتیب تکرارهای دوتائی (%45/2)، سه تائی (%30/72) و چهار تائی ( (%23/1 شایع ترین تکرارها در بین تکرارهای موجود در رونوشت های ثبت شده گیاه پرتقال میباشند. روند مشابهی در بین نشانگرهای میکروساتلیتی توسعه یافته مشاهده گردید بطوریکه تعداد نشانگرهایی که برای آنها آغازگر طراحی گردید به ترتیب در مورد تکرارهای دوتائی، سه تائی و چهارتائی، 1168، 1159 و 70 عدد بود. تنوع بالایی هم از نظر نوع توالی در نوع هر تکرار مشاهده گردید، بطوریکه در تکرارهای دوتائی نوع تکرارهای AG/GA بیشترین فراوانی ( (1864 و تکرارهای GC/CG کمترین فراوانی 6) عدد) را به خود اختصاص دادند. با توجه به قابلیت بالای انتقال پذیری نشانگرهای میکروساتلیتی مبتنی بر ESTs، به نظر میرسد نشانگرهای شناسائی شده توانائی بالائی برای شناسایی و گروهبندی انواع مرکبات دارا بوده و در مطالعات مربوط به شناسایی، نقشهیابی و انتخاب به کمک نشانگر در جنس سیتروس مفید واقع شوند.

Keywords:

Paper COI Code

This Paper COI Code is BAGHBANI11_619. Also You can use the following address to link to this article. This link is permanent and is used as an article registration confirmation in the Civilica reference:

https://civilica.com/doc/941472/

How to Cite to This Paper:

If you want to refer to this Paper in your research work, you can simply use the following phrase in the resources section:
زارعی، عبدالکریم و ابراهیمی، عزیز،1398،غربالگری توالی های ثبت شده از نواحی بیان شونده ژنوم پرتقال برای تشخیص نشانگرهای مبتنی بر میکروساتلایت،11th Congress of Iranian Horticultural Science،Urmia،https://civilica.com/doc/941472

Research Info Management

Certificate | Report | من نویسنده این مقاله هستم

اطلاعات استنادی این Paper را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

Scientometrics

The specifications of the publisher center of this Paper are as follows:
Type of center: دانشگاه دولتی
Paper count: 289
In the scientometrics section of CIVILICA, you can see the scientific ranking of the Iranian academic and research centers based on the statistics of indexed articles.

مقالات پیشنهادی مرتبط

New Papers

Share this page

More information about COI

COI stands for "CIVILICA Object Identifier". COI is the unique code assigned to articles of Iranian conferences and journals when indexing on the CIVILICA citation database.

The COI is the national code of documents indexed in CIVILICA and is a unique and permanent code. it can always be cited and tracked and assumed as registration confirmation ID.

Support