استفاده از سیستم CRISPR/Cas9 برای دستکاری ژن SGR فستوکای بلند بر اساس بیان موقت

Publish Year: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 442

This Paper With 9 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOPP-26-1_003

تاریخ نمایه سازی: 11 آبان 1398

Abstract:

چکیده سابقه و هدف: یکی از فناوری های پیشرفته در ویرایش ژنوم، مربوط به فناوری تکرارهای کوتاه پالیندرومی فاصله دار منظم خوشه ای است. در این پژوهش RNA راهنمای مربوط به ژن SGR درگیر در تجزیه کلروفیل، در تماس نزدیک با پروتئین Cas9 در سازه CRISPR برای هدف قرار دهی این ژن در برگ های فستوکای بلند قرار گرفت. مواد و روش ها: در راستای ساخت سازه CRISPR/Cas9 قابل برنامه ریزی برای هدف گیری ژن SGR، ابتدا یک توالی 20 نوکلئوتیدی روی اگزون ژن SGR فستوکای بلند انتخاب گردید. این توالی ابتدا در سازه pEnChimera جاسازی و سپس به وسیله فناوری Gateway به حامل بیان منتقل گردید. حامل مد نظر پس از تایید به وسیله واکنش زنجیرهای پلی مراز و توالی یابی، به Agrobacterium tumefaciens برای آزمایش های بیان موقت منتقل گردید. در گام دوم سازهCRISPR و سازه تشدید بیان (pB2WG7) دارای ناحیه رمز کننده ژن SGR به طور همزمان به برگ های توتون به وسیله روش Agroinfiltration منتقل گردید. ناحیه آلوده شده پس از استخراج DNA توالی یابی شد. در آزمایشی دیگر سازه CRISPR طراحی شده به طور مستقیم و به صورت موقت در برگ های بالغ جوان فستوکای بلند تحت تنش، بیان گردید. یافته ها: واکنش زنجیره ای پلی مراز و توالی یابی، جایگیری درست RNA راهنما را در دو حامل به کار رفته در این آزمایش تایید می-نماید. بیان موقت همزمان دو سازه در برگ های توتون که با استفاده از استخراج DNA و توالی یابی از محل آلوده ارزیابی شد، نشان می دهد که با وجود قرار گیری درست توالی در این سازه در عمل قادر به برش ژن SGR فستوکای بلند بیان شده در گیاه توتون نمی باشد. ولی در آزمایش دوم بیان موقت سازه CRISPR/Cas9 در برگ های فستوکای بلند دارای ژن طبیعی SGR بیانگر این است که این سازه به شکل جالبی قادر به توقف بیان ژن SGR و در نتیجه توقف تجزیه کلروفیل برگهای فستوکای بلند در مقایسه با شاهد می باشد. نتیجه گیری: استفاده از فناوری Gateway به میزان چشمگیری در مقایسه با روش آنزیم های برشی سرعت و دقت در ساخت سازه نهایی CRISPR/Cas9 را بالا برد. فناوری CRISPR/Cas9 زمانی که روی برگ های توتون برای هدف قرار دهی ژن SGR فستوکای بلند استفاده شد موفقیت آمیز نبود که به احتمال به دلیل بیان غیر هدفمند در موجودی است که ژن SGR به طور طبیعی در آن وجود ندارد ولی زمانی که سازه به صورت موقت در برگ های دارای ژن اصلی SGR (فستوکای بلند) بیان شد نتایج مشاهده شده به طور آشکاری بیانگر این بود که ژن SGR فستوکای بلند به وسیله CRISPR غیر فعال گردیده و در نتیجه آن در شرایط تنش برگ های فستوکای بلند سبزتر باقی ماندند.

Authors

مصطفی خوشحال سرمست

گروه باغبانی، دانشکده تولید گیاهی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Barrangou, R. 2013. CRISPR-Cas ...
  • systems and RNA-guided interference. ...
  • Wiley Interdiscip Rev. RNA. 4: 267-278. ...
  • Brooks, C., Nekrasov, V., Lippman, Z.B. ...
  • and Van Eck, J. 2014. Efficient gene ...
  • editing in tomato in the first generation ...
  • using the clustered regularly interspaced ...
  • short palindromic repeats/CRISPRassociated Cas9 system. Plant Physiol. ...
  • Deltcheva, E., Chylinski, K., Sharma, ...
  • C.M., Gonzales, K., Chao, Y., Pirzada ...
  • Z.A., Eckert, M.R., Vogel, J. and ...
  • Charpentier, E. 2011. CRISPR RNA ...
  • maturation by trans-encoded small RNA ...
  • and host factor RNase III. Nature. ...
  • Fan, D., Liu, T., Li, C., Jiao, B., Li, S., ...
  • Hou, Y. and Luo, K. 2017. Efficient ...
  • CRISPR/Cas9-mediated targeted mutagenesis ...
  • in Populus in the first generation. Nature. ...
  • Feng, Z., Zhang, B., Ding, W., Liu, X., Yang, ...
  • D.L., Wei, P., Cao, F., Zhu, S., Zhang, F., ...
  • Mao, Y., and Zhu, J.K. 2013. Efficient ...
  • genome editing in plants using a CRISPR/Cas ...
  • system. Cell Res. 23: 1229-1232. ...
  • Gaj, T., Gersbach, C.A. and Barbas, CF. ...
  • 3. ZFN, TALEN, and CRISPR/Casbased methods for genome engineering. ...
  • Trends Biotechnol. 31: 397-405. ...
  • Jia, H. and Wang, N. 2014. Targeted ...
  • genome editing of sweet orange using ...
  • Cas9/sgRNA. PLoS One 9: e93806. ...
  • Jiang, W., Zhou, H., Bi, H., Fromm, M., ...
  • Yang, B. and Weeks, D.P. 2013. ...
  • Demonstration of CRISPR/Cas9/sgRNAmediated targeted gene modification in ...
  • Arabidopsis, tobacco, sorghum and rice. ...
  • Nucleic Acids Res. 41:e188. ...
  • Li, J.F., Norville, J.E., Acch, J., ...
  • McCormack, M., Zhang, D., Bush, J., ...
  • Church, G.M. and Sheen, J. 2013. ...
  • Multiplex and homologous recombinationmediated genome editing in Arabidopsis ...
  • and Nicotiana benthamiana using guide ...
  • RNA and Cas9. Nat Biotechnol. 31: 688-691. ...
  • Lu, J., Bai, M., Ren, M., Liu, J. and ...
  • Wang, C. 2017. An efficient transient ...
  • expression system for gene function ...
  • analysis in rose. Plant Methods. 13: 116. ...
  • Miao, J., Guo, D., Zhang, J., Huang, Q., ...
  • Qin, G., Zhang, X., Wan, J., Gu, H. and ...
  • Qu, L.J. 2013. Targeted mutagenesis in ...
  • rice using CRISPR-Cas system. Cell ...
  • Res. 23: 1233-1236. ...
  • Ren, G., An, K., Liao, Y., Zhou, X., Cao, ...
  • Y., Zhao, H., Ge, X. and Kuai, B. 2007. ...
  • Identification of novel chloroplast protein ...
  • AtNYE1 regulating chlorophyll degradation ...
  • during leaf senescence in Arabidopsis. ...
  • Plant Physiol. 144: 1429-1441. ...
  • Sarmast, M.K., Niazi, A., Salehi, H. and ...
  • Abolimoghadam, A. 2015. Silver ...
  • nanoparticles affect ACS expression in ...
  • Tecomella undulata in vitro culture. ...
  • Plant Cell Tiss. Org. Cult. 121: 227-236. ...
  • Xie, K. and Yang, Y. 2013. RNA-guided ...
  • genome editing in plants using a ...
  • CRISPR-Cas system. Mol. Plant. ...
  • Zhang, H., Zhang, J., Wei, P., Zhang, B., ...
  • Gou, F., Feng, Z., Mao, Y., Yang, L., ...
  • Zhang, H., Xu, N. and Zhu, J.K. 2014. ...
  • The CRISPR/Cas9 system produces ...
  • specific and homozygous targeted gene ...
  • editing in rice in one generation. Plant ...
  • Biotechnol. J. 12: 797-807. ...
  • Zhang, Y., Liang, Z., Zong, Y., Wang, ...
  • Y., Liu, J., Chen, K., Qiu, J.L. and ...
  • Gao, C. 2016. Efficient and transgenefree genome editing in wheat ...
  • transient expression of CRISPR/ ...
  • Cas9 DNA or RNA. Nature Commun. ...
  • نمایش کامل مراجع