تعیین توالی نوکلئوتیدی ژن F سویه واکسینالClone IR 12 ویروس نیوکاسل موسسه رازی

Publish Year: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 449

This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_VTJ-32-3_002

تاریخ نمایه سازی: 3 آذر 1398

Abstract:

ویروس نیوکاسل یکی از مهم ترین ویروس های صنعت طیور می باشد. این ویروس با توجه به حدت سویه های مختلف، علائم کلینیکی و تلفات متفاوتی دارد. پروتئین فیوژن یکی از پروتئین های مهم این ویروس، نقش مهمی در تعیین حدت ویروس دارد. در این مطالعه توالی ژنومی این پروتئین تعیین توالی گردیده است. بدین منظور واکسن کلون IR .12، که از سویه ویروس لاسوتا به روش پلاک اسی در موسسه رازی تهیه شده بود، انتخاب گردید. ابتدا ویروس با رقت مناسب به حفره آلانتوئیک تخم مرغ SPF دارای جنین ده روزه تزریق شد. و پس از طی زمان مناسب برای رشد ویروس، مایع آلانتوئیک آن جمع آوری شد. ویروس با استفاده ازسانتریفوژ دور بالاو گرادیانت ساکارز به صورت مناسب تخلیص شد. RNA ویروس استخراج، و قطعه cDNA از روی ژنوم ساخته شد. پرایمرهای مناسب طراحی شد و  PCR انجام گرفت. محصول PCR استخراج گردید. محصول استخراج در پلاسمید مناسب کلون شد. محصول کلون شده به باکتری ترانسفورم شد. باکتری حاوی پلاسمید در دمای مناسب تکثیر پیدا کرد.پلاسمید به روش Sambrook استخراج گردید. برای اطمینان از کلونینگ موفق آنزیم برشی BglII استفاده شد. پس از این مرحله پلاسمید برای تعیین توالی به روش سنگر آماده شد. نتایج با استفاده از نرم افزار مگا 5 توالی ژنومی تحلیل و همردیف سازی انجام گرفت  شد.در نتیجه این مطالعه توالی ژن Fبه صورت کامل تعیین توالی، و با سویه های لنتوژنیک موجود در بانک ژن مقایسه و بررسی شد. در نتیجه آن توالی ژنومی در این مطالعه با برخی توالی های بانک ژن به طور کامل همردیف هستند و با برخی توالی های دیگر در برخی نوکلئوتید ها متفاوت می باشد.

Authors

ایوب سلیمی

دانشجوی کارشناسی ارشد ویروس شناسی موسسه رازی

آیدین ملوکی

عضو هیت علمی موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی

حسین گودرزی

عضو هیت علمی موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی

سیدرضا ابراهیمی

عضو هیت علمی موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Aldous, E.W. and D.J. Alexander .2001. Detection and differentiation of ...
  • Alexander, D.J., E.W. Aldous, and C.M. Fuller .2012. The long ...
  • Angel E. Absalón; Andrea Mariano; MatíasAlejandra; Vásquez-MárquezAndrés; Morales; Garzón Diana ...
  • de Leeuw, O.and Peeters .1999. Complete nucleotide sequence of Newcastle ...
  • Diego G. Diel, Leonardo Susta, Stivalis Cardenas Garcia, Mary L. ...
  • Ebrahimi MM, Shahsavandi S, Famil-Ghadakchi H, Masoudi S, Ghodsian N, ...
  • Ganar K, Das M, Sinha S, Kumar S .2014. Newcastle ...
  • Guoyuan Wen, Yu Shang, Jing Guo, Chen Chen, Huabin Shao, ...
  • Kavitha Murulitharan, Khadijah Yusoff, Abdul Rahman Omar, Aidin Molouki .2013. ...
  • Bruschke C, Vallat B. 2008. OIE standards and guidelines related ...
  • Yurchenko KS, Sobolev IA, Glushchenko AV, Shestopalov AM. .2015. Complete ...
  • Yurchenko KS, Zhou P, Kovner AV, Zavjalov EL, Shestopalova LV, ...
  • Westbury H .2001. Newcastle disease virus: an evolving pathogen. Avian ...
  • نمایش کامل مراجع