تجزیه و تحلیل ژنتیکی و فیلوژنتیکی بخشی از ژنوم میتوکندری در گاومیش های خوزستان

Publish Year: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 685

This Paper With 16 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-11-3_009

تاریخ نمایه سازی: 3 دی 1398

Abstract:

هدف: مطالعه مولکولی ساختار ژنتیکی گاومیش برای شناخت دقیق تر خاستگاه این حیوان می تواند موثر باشد. در بین نشانگرهای مولکولی، توالی یابی ژنوم میتوکندری یکی از بهترین و رایج ترین روش ها برای طبقه بندی ژنتیکی جمعیت ها و گونه های نزدیک به هم، بررسی امکان اشتقاق گونه های مختلف از یک جد مشترک، مطالعه رابطه فیلوژنی هر موجود با سایر گونه ها و نژادها و دستیابی به راهکارهایی برای حفظ ذخایر ژنتیکی می باشد. هدف از این تحقیق تعیین توالی نواحی 12s rRNA و 16s rRNA ژنوم میتوکندری گاومیش خوزستان و تجزیه و تحلیل ژنتیکی و فیلوژنتیکی بخشی از آن بود. مواد و روش ها: برای انجام این تحقیق تعداد 30 عدد نمونه خون از هر دو جنس از گاومیش های غیرخویشاوند جمع آوری شد. پس از استخراج DNA از آن ها، ناحیه مورد نظر توسط پرایمرهای اختصاصی با تکنیک PCR تکثیر و پس از خالص سازی توالی یابی شدند. نتایج: نتایج حاصل از هم ردیف کردن توالی های نواحی 12srRNA و 16srRNA گاومیش خوزستان نشان داد که هیچگونه جهشی در جمعیت مذکور وجود ندارد که این امر بیانگر سطح تنوع پایین در جمعیت گاومیش خوزستان می باشد. براساس این تحقیق، نواحی 12srRNA و 16srRNA ناحیه کد کننده می باشد و میزان جهش و تنوع در آن پایین است. نتایج آزمون فیلوژنتیکی با استفاده از UPGMA برای هر دو جایگاه نشان داد که گاومیش های ایران با گاومیش های هندی و ایتالیایی در یک خوشه و نزدیک به هم می باشند. نتیجه گیری: توالی حاصل از این مناطق برای اولین بار در بانک ژن با کد دسترسی MG650115 ثبت شد و با اضافه شدن نام گاومیش خوزستان در بانک جهانی ژن، این نژاد به انجمن های بین المللی معرفی شد.

Authors

سیما ساور

موسسه تحقیقات علوم دام کشور

حمیدرضا سیدآبادی

موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران

سیروس عیدی وندی

گروه علوم دامی دانشگاه آزاد اسلامی، واحد بهبهان، بهبهان، ایران

ایمان حرسی

فارغ التحصیل مقطع کارشناسی ارشد، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد بهبهان، بهبهان، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • بهاری زاده مریم، واعظ ترشیزی رسول (1390) بررسی عوامل محیطی ...
  • خراتی کوپایی حامد، محمدآبادی محمدرضا، ترنگ علیرضا و همکاران (1391) ...
  • خراتی کوپایی حامد، محمدآبادی محمدرضا، انصاری مهیاری سعید و همکاران ...
  • محمدی اکرم، محمدآبادی محمدرضا، میرزایی حمیدرضا و همکاران (1386) مطالعه ...
  • علینقی زاده روح الله، محمدآبادی محمدرضا، زکی زاده سونیا (1389) ...
  • واجد ابراهیمی محمدتقی، محمدآبادی محمدرضا، اسماعیلی کشکوئیه علی (1394) بررسی ...
  • هادی زاده مرتضی، محمدآبادی محمدرضا، اسماعیلی زاده علی و همکاران ...
  • هادی زاده مرتضی، محمدآبادی محمدرضا، نیازی علی و همکاران (1392) ...
  • Alinaghizadeh H, Mohammad Abadi MR, Zakizadeh S (2010) Exon 2 ...
  • Baharizadeh M, VAez Torshizi R (2011) Investigation of environmental effects ...
  • Dalmasso A,  Fontanella  E,  Piatti  P  et al. (2004)  A  ...
  • Denver DR, Morris K, Lynch M et al. (2000) High ...
  • Ghovvati S,  Nassiri  MR,  Mirhoseini SZ et al. (2008) Fraud ...
  • Guha S, Goyal SP, Kashyap VK (2006) Genomic variation in ...
  • Hadizadeh M, Mohammadabadi MR, Niazi A et al. (2013) Use ...
  • Hadizadeh M, Niazi A, Mohammad Abadi M et al. (2014). ...
  • Hiendleder S, Lewalski H, Wassmuth R et al. (1998) The ...
  • Kharrati Koopaei H, Mohammad Abadi MR, Ansari Mehyari S et ...
  • Kharrati Koopaei H, Mohammadabadi MR, Ansari Mehyari S  et al. ...
  • Kharrati koopaei H, Mohammadabadi MR, Tarang A et al. (2012) ...
  • Khodabakhshzadeh R, Mohammadabadi MR, Esmailizadeh Koshkoieh A et al. (2016b) ...
  • Lalitha S (2000) Primer premier 5. Biotech Software & Internet ...
  • Manea BG, Mendirattaa SK, Tiwarib AK et al. (2013) Sequence ...
  • Miller SA, Dykes DD, Polesky HF (1998)  A Simple salting ...
  • Mohammadabadi MR (2017) Role of clostridium perfringens in pathogenicity of ...
  • Mohammadabadi MR, Esfandyarpoor E, Mousapour A (2017) Using Inter Simple ...
  • Mohammadi A, Mohammadabadi MR, Mirzaei H et al. (2009) Study ...
  • Moioli B (2005) Breeding and selection of dairy buffalo. FAO ...
  • Nagarajan M, Nimisha K, Kumar S (2015) Mitochondrial   DNA   Variability   ...
  • Ramadan H (2011) Sequence of specific mitochondrial 16S rRNA gene ...
  • Ramadan HAI, Mahfoz  I (2008) Phylogenetic analysis and comparison between ...
  • Vajed Ebrahimi MT, Mohammad Abadi MR, Esmailizadeh AK (2016) Analysis ...
  • Vajed Ebrahimi MT, Mohammad Abadi MR, Esmailizadeh AK (2017) Using ...
  • Zamani P, Akhondi M, Mohammadabadi MR (2015) Associations of Inter-Simple ...
  • نمایش کامل مراجع