ناشر تخصصی کنفرانس های ایران

لطفا کمی صبر نمایید

Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings

Please waite ..
CIVILICAWe Respect the Science
Publisher of Iranian Journals and Conference Proceedings
Paper
Title

Identification of novel short tandem repeats based markers in the expressed sequence of Malus domestica Borkh.

Year: 1397
COI: CIGS15_164
Language: EnglishglishView: 146
This Paper With 6 Page And PDF Format Ready To Download

Buy and Download

با استفاده از پرداخت اینترنتی بسیار سریع و ساده می توانید اصل این Paper را که دارای 6 صفحه است به صورت فایل PDF در اختیار داشته باشید.
آدرس ایمیل خود را در کادر زیر وارد نمایید:

Authors

Abdolkarim Zarei - Department of Biotechnology, Agriculture College, Jahrom University, Jahrom, Iran

Abstract:

Apple (Malus domestica Borkh.) is an economically important fruit crop worldwide. There are huge amount of transcriptomics derived sequences of this fruit tree in the public databases that provide a good source for development of expressed sequence tags (ESTs) based markers including EST-SSRs. In the present study, EST sequences of apple available in NCBI were exploited to estimate, analysis and characterize simple sequence repeats and to develop SSR molecular markers. Data mining in 326941 sequences revealed that 10340 sequences contained at least one SSR (on average 3.16 % of deposited sequences). In total 10693 EST-SSRs were identified that 4295 ones (40.16%) were suitable for primer development. Motif frequencies were highly variable and dinucleotide repeats with 86% of identified SSRs were the most abundant followed by trinucleotide (12%), and tetranucleotide (2%) repeats. The same trend was observed for SSRs with primers. AG/GA/CT/TC motif were the most abundant repeat unit in apple ESTs and included 76% of identified SSRs. Validation of some of the identified SSRs are underway by evaluation their polymorphism on different apple cultivars.

Keywords:

Repeat unit, data mining, apple, EST-SSR

Paper COI Code

برای لینک دهی به این Paper می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت Paper در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:

https://civilica.com/doc/983769/

How To Citation:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این Paper ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
Zarei, Abdolkarim,1397,Identification of novel short tandem repeats based markers in the expressed sequence of Malus domestica Borkh.,سومین کنگره بین المللی و پانزدهمین کنگره ملی ژنتیک ایران,تهران,,,https://civilica.com/doc/983769

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این Paper اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (1397, Zarei, Abdolkarim؛ )
برای بار دوم به بعد: (1397, Zarei؛ )
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

Research Info Management

Certificate | Report | من نویسنده این مقاله هستم

اطلاعات استنادی این Paper را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

New Papers

Share this page

More information about COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.

Support