بررسی بیوانفورماتیکی و جداسازی پروموتر بتافازیولین از لوبیا Phaseolus vulgaris
Publish place: Iranian journal of Pulses Research، Vol: 8، Issue: 2
Publish Year: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 260
This Paper With 11 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_IJPR-8-2_007
تاریخ نمایه سازی: 3 اسفند 1398
Abstract:
جهت اجتناب از مضرات پروموترهای عمومی، شناسایی و جداسازی پروموترهای قوی و اختصاصی بافت امری بسیار مهم و ضروری در مهندسی ژنتیک است. یکی از پروموترهای اختصاصی و قوی بذری، پروموتر بتافازیولین لوبیا میباشد که بیان حدود 50درصد پروتیینهای بذر لوبیا را کنترل میکند. استفاده از این پروموتر برای بهینهکردن تولید پروتیینهای بذری در لوبیا و گیاهان دیگر و همچنین تولید پروتیینهای نوترکیب مفید خواهد بود. آنالیز بیوانفورماتیکی پروموترها برای پیشگویی در مورد قدرت و ضعف آنها، جداسازی صحیح و همچنین سنتز پروموترهای مصنوعی کمک خواهد کرد. ابتدا بهوسیله نرمافزارهای آنالیز پروموتر توالیهای پروموتری بتافازیولین گیاه لوبیا مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. نتایج حاصل نشان داد که بیش از 20فاکتور سیس از جمله مهمترین آنها G-box، E-box، فاکتور RY،ACGTSEED2، جعبه لگومین، جعبه اندوسپرم و...در توالی پروموتر بتافازیولین وجود دارد که در بیان بالا و اختصاصیت آن نقش دارند. با توجه به نتایج آنالیز بیوانفورماتیکی پرایمرهای اختصاصی این پروموتر طراحی شد و با استفاده از آنها توالی پروموتر موردنظر از DNA ژنومی لوبیا تکثیر و با توجه به اندازه قطعه تکثیرشده، صحت آن مورد تایید قرار گرفت. در مرحله بعدی توالی پروموتر موردنظر در ناقل pTZ57R/T کلون شد و با استفاده از واکنش های PCR و هضم آنزیمی مورد تایید قرار گرفت. از آنجاییکه هدف از این تحقیق جداسازی پروموتر اختصاصی بذر بتافازیولین از لوبیا و استفاده از آن در تهیه سازه های ژنی میباشد، لذا قطعه موردنظر در ناقل بیانی گیاهی pBI121 ساب کلون شد و نتایج آن با هضم آنزیمی و PCR تایید شد.
Keywords:
Authors
ادریس چوپانی
دانش آموخته کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجان
خدیجه باقری
استادیار بخش زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجان
بهرام ملکی زنجانی
دانشیار بخش زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجان