آنالیز فیلوژنتیکی ناحیه سیتوکرومB ژنوم میتوکندری چند نژاد بز بومی ایران

Publish Year: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 436

This Paper With 16 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-11-4_002

تاریخ نمایه سازی: 18 فروردین 1399

Abstract:

هدف: شناسایی تنوع ژنتیکی نژادهای بز بومی ایران، می­تواند در حفاظت و نگهداری از این نژادها در برنامه­های مدیریتی نقش بسیار مهمی ایفا کند. لذا این پژوهش با هدف بررسی فیلوژنتیکی توالی نوکلئوتیدی ناحیه سیتوکروم b ژنوم میتوکندری چهار نژاد لری، پاکستانی، زابلی و عدنی انجام شد. مواد و روش‎ها: نمونه خون 16 راس بز، از هر نژاد 4 راس، جمع­آوری گردید. پس از استخراج DNA، تکثیر قطعه 684 جفت بازی ناحیه سیتوکروم b میتوکندری با آغازگرهای اختصاصی انجام شد و قطعات تکثیر شده پس از خالص­سازی به صورت رفت و برگشت توالی­یابی شدند. با نرم­افزار  DNASpشش هاپلوتیپ و 9 جایگاه چندشکل در توالی­ها تعیین گردید. نتایج: بیشترین تنوع نوکلئوتیدی مربوط به نژاد پاکستانی 35461/0 و کمترین تنوع نوکلئوتیدی مربوط به نژاد زابلی 11199/0 به دست آمد. مقدار dn/ds نمونه­های تاجیمای مورد بررسی 06945/1 برآورد شد که موید روند انتخاب طبیعی این ژن در طول دوره تکامل بود. همچنین نتایج حاصل از آنالیز واریانس مولکولی نشان داد 80 درصد تنوع ژنتیکی داخل جمعیتی و 20 درصد بین جمعیتی بود که نشان دهنده جریان ژنی بالا، مهاجرت در بین جمعیت­های مورد مطالعه و یا تعداد محدود نمونه­های مورد پژوهش می­باشد. نتیجه گیری: نتایج آنالیز فیلوژنتیکی نشان داد بزهای نژاد لری و عدنی به همراه Capra hircus در یک گروه و بزهای نژاد پاکستانی و زابلی نیز به صورت مجزا گروه تشکیل دادند که این امر نشان دهنده منشا مشترک این نژادها با توجه به منطقه جغرافیایی محل زندگی آن­ها است.

Authors

فرهاد صمدیان

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوج، ایران

هوشنگ دارفرین

فارغ التحصیل کارشناسی ارشد، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوج، ایران

مصطفی قادری زفره‎ای

استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوج، ایران

آزاده ترابی

استادیار، گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور،

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • توحیدی نژاد فاطمه، محمدآبادی محمدرضا، اسمعیلی زاده کشکوئیه علی، نجمی ...
  • عسکری ناهید، باقی زاده امین، محمدآبادی محمدرضا (1389) بررسی تنوع ...
  • عسکری ناهید، محمدآبادی محمدرضا، بیگی نصیری محمد تقی، باقی زاده ...
  • علی نقی‎زاده روح الله ، محمدابادی محمدرضا، زکی زاده سونیا ...
  • نبی حسنی محمد، اسدی فوزی مسعود، علی اسمعیلی زاده، محمدآبادی ...
  • Alinaghizadeh H, Mohammad Abadi MR, Zakizadeh S (2010) Exon 2 ...
  • Askari N, Baghizadeh A, Mohammadabadi MR (2008) Analysis of the ...
  • Askari N, Mohammadabadi MR, Beigi Nasiri MT, Bagizadeh A, Fayyazi ...
  • Baghizadeh A, Bahaaddini M, Mohamadabadi MR. Askari N (2009) Allelic ...
  • Barazandeh A, Moghbeli SM, Vatankhah M, Mohammadabadi MR (2012) Estimating ...
  • Barnett, RG. Larson (2012) A phenol-chloroform protocol for extracting DNA ...
  • Batubara A (2011) Phenotypic and genetic diversity study of some ...
  • Budisatria IGS, Udo HMJ, van der Zijpp AJ et al. ...
  • Chen S, Fan B, Liu B et al. (2006) Genetic ...
  • Ewing B, Green P (1998) Based-Calling of Automated Sequencer Traces ...
  • Eyre-walker A, Awadalla P (2001) Does human mtDNA recombine. J ...
  • Galtier N, Nabholz B, Glémin S, Hurst G (2009) Mitochondrial ...
  • Gholizadeh M, Mianji G, Zadeh H (2008) Potential use of ...
  • Hall, TA, Carlsbad C (2011) BioEdit: An important software for ...
  • Hedayat-Evrigh N, Vahedi V, Seyed Sharifi R, Boustan A (2016) ...
  • Ishida N, Hasegawa T, Takeda K et al. (1994) Polymorphic ...
  • Lalitha, S. (2000) Primer premier 5. Biotech Software & Internet ...
  • Larkin MA, Blackshields G, Brown N et al. (2007) Clustal ...
  • Librado P, Rozas J (2009) DnaSP v5: a software for ...
  • Liu Y, Cao S, Chen S et al. (2009) Genetic ...
  • Moghadaszadeh M, Mohammadabadi MR, Esmailizadeh Koshkoieh A (2015) Association of ...
  • Mohammadabadi MR (2012) Relationships of IGFBP-3 gene polymorphism with cashmere ...
  • Mohammadabadi MR, Askari N, Baghizadeh A, Esmailizadeh A (2009) A ...
  • Mohammadabadi MR, Esfandyarpoor E, Mousapour A (2017) Using Inter Simple ...
  • Molaei Moghbeli S, Barazandeh A, Vatankhah M, Mohammadabadi MR (2013) ...
  • MacCarthy, C. 2005. Chromas. Technelysium Pty Ltd. ...
  • Nabi Hassani M, Asadi Fozi M, Esmailizadeh AK and Mohammadabadi ...
  • Naderi S, Rezaei HR, Taberlet P et al. (2007) Large-scale ...
  • Nei M, Kumar S (2000) Molecular Evolution and Phylogenetics. Oxford ...
  • Pakpahan S, Artama WT, Suparta IG (2016a) Genetic characteristics and ...
  • Pakpahan S, Artama WT, Widayanti R, Budisatria IGS (2016b) Molecular ...
  • Pakpahan S, Artama WT, Widayanti R, Suparta IG (2015) Genetic ...
  • Pariset L, Joost S, Gargani M, Valentini A (2012) Landscape ...
  • Rahman A, Ramli A, Wan Embong W (2008) A review ...
  • Saitou N, Nei M (1987) The neighbor-joining method: a new ...
  • Sawaimul A, Sahare M, Ali S et al. (2014) Assessment ...
  • Sayers EW, Barrett T, Benson DA et al. (2011) Database ...
  • Shamsalddini S, Mohammadabadi MR, Esmailizadeh AK (2016). Polymorphism of the ...
  • Shojaei M, Mohammad Abadi MR, Asadi Fozi M et al. ...
  • Stamatakis A (2006) RAxML-VI-HPC: maximum likelihood-based phylogenetic analyses with thousands ...
  • Sultana S, Mannen H, Tsuji S (2003) Mitochondrial DNA diversity ...
  • Takada T, Kikkawa Y, Yonekawa H et al. (1997) Benzor ...
  • Tamura K, Stecher G, Peterson D et al. (2013) MEGA6: ...
  • Tobe S, Linacre A (2008) A multiplex assay to identify ...
  • Tohidi nezhad F, Mohammadabadi MR, Esmailizadeh AK, Najmi Noori A ...
  • Vajed Ebrahimi MT, Mohammad Abadi MR, Esmailizadeh AK (2016). Analysis ...
  • Vajed Ebrahimi MT, Mohammad Abadi MR, Esmailizadeh AK (2017). Using ...
  • Widayanti R, Agustianti T, Kunda RM, Pakpahan S (2016) Phylogenetic ...
  • Zamani P, Akhondi M, Mohammadabadi MR (2015) Associations of Inter-Simple ...
  • Zewdu E, Hailu D, Sang-Wook K et al. (2013) Genetic ...
  • Zhao Y, Zhang J, Zhao E et al. (2011) Mitochondrial ...
  • نمایش کامل مراجع