تجزیه و تحلیل ژنتیکی ناحیه 12S rRNA شترهای تک کوهانه و دوکوهانه ایران

Publish Year: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 584

This Paper With 15 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-12-2_010

تاریخ نمایه سازی: 26 شهریور 1399

Abstract:

هدف: دانشمندان علوم دامی در سرتاسر جهان در پی یافتن منابع جدیدی از پروتئین حیوانی بوده و تلاش می کنند تا حیواناتی که بهترین ضریب تبدیل را دارند در اولویت کاری خود قرار دهند. از جمله این دام ها می توان به شتر اشاره کرد. تحقیقات جهت حفظ این ذخیره ژنتیکی با ارزش از حساسیت و اهمیت بیشتری برخوردار است. شناسایی تفاوت های ژنتیکی در توالی ژن های موجود در ژنوم میتوکندری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک، روشی سریع و قابل اطمینان برای شناسایی و طبقه بندی گونه ها است و یکی از موثرترین ابزارها در برآورد تنوع زیستی ژنتیکی و روابط فیلوژنتیک در نژادهای مختلف دام از جمله شتر محسوب می شود. هدف از انجام این پژوهش توالی یابی و مقایسه ساختار ژنتیکی ژن RNA غیر کدکننده زیر واحد کوچک ریبوزوم در شترهای تک کوهانه و دوکوهانه ایران بود. مواد و روش ها: برای انجام این پژوهش از 20 نفر شتر تک کوهانه و دو کوهانه ایرانی نمونه خون جمع آوری شد. پس از استخراج DNA ژن 12S rRNA با طول 1326 جفت باز در ژنوم میتوکندری توسط دو جفت آغازگر اختصاصی تکثیر و توالی یابی شدند. نتایج: وجود 3 هاپلوتایپ در شترهای دوکوهانه و 1 هاپلوتایپ در شترهای تک کوهانه در جمعیت مورد پژوهش ثابت شد که این هاپلوتایپ ها به ترتیب دارای دو جایگاه چند شکل (SNP) در شتر دو کوهانه است و در بین شترهای تک کوهانه هیچ تفاوت نوکلئوتیدی مشاهده نشد. درخت فیلوژنی پس از اخذ توالی های مشابه ژن 12S rRNA میتوکندری دیگر گونه های موجود در بانک جهانی ژن با استفاده از آنها ترسیم شد. نتیجه گیری: نتایج تجزیه و تحلیل فیلوژنی و تنوع ژنتیکی نشان داد گونه های شتر تک کوهانه و دو کوهانه در دو گروه متفاوت قرار دارند و شترهای دو کوهانه ایرانی تنوع ژنتیکی بالاتری دارند که نشان از قدمت تکاملی طولانی تر این گونه دارد. اطلاعات در مورد تنوع ژنتیکی در میان نژادهای شتر می تواند توسعه برنامه های اصلاح نژاد را تسهیل کند و یک الزام برای حفظ منابع ژنتیکی است.

Authors

آزاده ترابی

استادیار، گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور،

زهرا رودباری

عضو هیات علمی دانشگاه جیرفت

مجتبی طهمورث پور

دانشگاه فردوسی مشهد

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • بررسی تنوع ژنتیکی و اثر انتخاب ژن های RNA ریبوزومی و ناقل در ژنوم میتوکندری شترهای تک کوهانه و دو کوهانه [مقاله ژورنالی]
  • شهابی امین، طهمورث پور مجتبی (1394) تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی ...
  • صمدیان فرهاد، دارفرین هوشنگ، قادری زفره‎ای مصطفی، ترابی آزاده، شریعت ...
  • قاسمی میمندی مهرداد، محمدآبادی محمدرضا، اسمعیلی زاده کشکوئیه علی، منتظری ...
  • قاسمی مهرداد، محمدآبادی محمدرضا، اسمعیلی زاده‎ علی (1394) تنوع ژنتیکی ... [مقاله ژورنالی]
  • قاسمی میمندی مهرداد، محمدآبادی محمدرضا، منتظری مهدیه‎ (1395) ارزیابی ساختار ...
  • محمدآبادی محمدرضا، قاسمی میمندی مهرداد، منتظری مهدیه‎ (1397) بررسی تنوع ...
  • هدایت ایوریق نعمت، واحدی وحید، سیدشریفی رضا، آزاده بوستان (1395) ...
  • همتی بهزاد، بناءبازی محمدحسین، شاه کرمی سعید، مهندسان المیرا، برگر ...
  • Al-Swailem AM, Al-Busadah KA, Shehata M et al. (2007) Classification ...
  • Al Ghumlas AK, Abdel Gader AG, Hussein MF, Al Haidary ...
  • Barazandeh A, Mohammadabadi MR, Ghaderi M, Nezamabadipour H (2016) Genome-wide ...
  • Barazandeh A, Mohammadabadi MR, Ghaderi-Zefrehei M, Rafeied F, Imumorin IG ...
  • Bellagamba F, Moretti V, Comincini S, Valfare F (2001) Identification ...
  • Cui P, Ji R, Ding R et al. (2007) A ...
  • Eltanany M, Elfaroug O, Sidahmed S, Distl O (2015) Assessment ...
  • Ewing B, Green P (1998) Based-Calling of Automated Sequencer Traces ...
  • Eyre-walker A, Awadalla P (2001) Does human mtDNA recombine. J ...
  • Ghasemi Meymandi, Mohammadabadi MR, Esmailizadeh A (2015) Genetic variation of ...
  • Ghasemi Meymandi M, Mohammadabadi MR, Montazeri M (2016) Analysing Genetic ...
  • Ghasemi Meymandi M, Mohammadabadi MR, Esmailizadeh Kashkoieh A, Montazeri M ...
  • Hall TA, Carlsbad C (2011) BioEdit: An important software for ...
  • Hemati B, Banabazi MH, Shahkarami S ,Mohandesan E, Burger P ...
  • Hedayat-Evrigh N, Vahedi V, Sharifi SR, Boustan A (2016) Sequencing ...
  • Hoter A, Rizk S, Naim HY (2019) Cellular and Molecular ...
  • Lalitha S (2000) Primer premier 5. Biotech Software & Internet ...
  • Librado P. Rozas J (2009) DnaSP v5: A software for ...
  • McCarthy C (2005). Chromas, pp. Technelysium Pty Ltd ...
  • Nei M, Kumar S (2000) Molecular Evolution and Phylogenetics. Oxford ...
  • Samadian F, Darfarin H, Ghaderi zefrehi M, Torabi A, Shariat ...
  • Shahabi A, Tahmorespour M (2015) Bioinformatics and Phylogenetic Analysis of ...
  • Tamura K, Stecher D, Peterson A et al. (2013) MEGA6: ...
  • Quinta R, Gomes L, Santos ATD (2004). A mitochondrial DNA ...
  • Othman E, Heba AM, El-KaderSally A et al. (2017) Cytochrome ...
  • Ouajd S, Kamel B (2009) Physiological particularities of dromedary (Camelus dromedarius) ...
  • Rodbari Z, Nasiri, K (2019) Study of Genetic diversity and ...
  • Warda M, Prince A, Kim HK et al. (2014) Proteomics ...
  • Yang L, Tan Z, Wang D et al (2014) Species ...
  • Zhao E, Yu Q, Zhang N, Kong D, Zhao Y ...
  • نمایش کامل مراجع