شناسایی جهش فقدان عملکرد p.Q۵۷۹X موثر بر سقط جنین در ژن APAF۱در گاوهای هلشتاین
Publish place: Research on Animal Production، Vol: 12، Issue: 31
Publish Year: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 267
This Paper With 11 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_RAP-12-31_016
تاریخ نمایه سازی: 4 مهر 1400
Abstract:
امروزه مشکلات تولید مثلی یکی از نگرانیهای اصلی در صنعت گاو شیری است. هدف از پژوهش حاضر شناسایی جهش فقدان عملکرد p.Q۵۷۹X موثر بر سقط جنین خود به خودی و مشکلات تولید مثلی در ژن APAF۱ با روش توالی یابی در گاو هلشتاین بود. در مجموع ۲۰۰ نمونه خون تهیه و استخراج DNA با کیت تجاری انجام شد. سپس یک جفت آغازگر اختصاصی برای تکثیر قطعه ای با طول ۴۵۶ جفت باز حاوی جهش مورد نظر طراحی و تعیین ژنوتیپ نمونه ها با روش PCR-SSCP انجام شد. در جایگاه APAF۱ دو آلل A و B و دو ژنوتیپ AA و AB به ترتیب با فراوانی های ۹۶/۷۶، ۳/۲۴، ۹۳/۵۱ و ۶/۴۹ درصد مشاهده شدند. ژنوتیپ BB در نمونه های مورد مطالعه مشاهده نشد. بعد از تعیین ژنوتیپ نمونه ها، از هر ژنوتیپ دو نمونه به صورت دو طرفه توالییابیشده و بعد از همترازی توالی های به دست آمده، مقایسه آنها با توالی رفرنس برای شناسایی جهش های مورد نظر با استفاده از نرم افزار BioEdit (version۷.۰.۹.۰ ) صورت گرفت. نتایج بررسی های بیوانفورماتیک نشان داد که جهش p.Q۵۷۹X که یکی از جهش های موثر بر سقط جنین در گاو هلشتاین می باشد در ژنوتیپ AB ژن APAF۱ در گاوهای هلشتاین در ایران وجود دارد. با توجه به اینکه این جهش در حالت هموزیگوت باعث سقط جنین در گاو میشود، می توان نتایج حاصل از این پژوهش را در برنامه های اصلاح نژادی در راستای شناسایی حاملین و حذف آنها از گله گاوهای شیری هلشتاین به کار برد.
Keywords:
Abortion , APAF۱ gene , Holstein cattle , Sequencing , توالی یابی , ژن APAF۱ , سقط جنین , گاو هلشتاین
Authors
خزان عنایتی
Department of Animal Sciences, Sari Agricultural Sciences and Ntural Resources University, Sari, Iran
ایوب فرهادی
Department of Animal Sciences, Sari Agricultural Sciences and Ntural Resources University, Sari, Iran
قدرت رحیمی میانجی
Department of Animal Sciences, Sari Agricultural Sciences and Ntural Resources University, Sari, Iran
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :