مقایسه روش های مختلف آماری در انتخاب ژنومی گاوهای هلشتاین
Publish place: Research on Animal Production، Vol: 7، Issue: 14
Publish Year: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 167
This Paper With 6 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_RAP-7-14_026
تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1400
Abstract:
انتخاب ژنومی، ارزشهای ژنتیکی را در صفات پیچیده کمی از طریق ترکیب دادههای ژنومی و فنوتیپی با استفاده از
مدلهای آماری پیشبینی میکند. صحت پیشبینی ارزشهای ژنتیکی در جمعیت تحت انتخاب اثر زیادی بر موفقیت این روش انتخاب دارد. مدل آماری که برای برآورد اثرات نشانگری در جمعیت مرجع از آن استفاده میشود، از عوامل موثر بر صحت پیشبینیها میباشد. عوامل مختلفی مانند تراکم نشانگری، جمعیت مرجع و معماری ژنتیکی صفت بر انتخاب بهترین مدل آنالیز تاثیر گذارند. در این مطالعه، گاوهای هلشتاین ایران شبیهسازی و مدلهای مختلف آنالیز در انتخاب ژنومی این جمعیت بررسی شدند. مدل GBLUP و چهار مدل بیزی A، B، LASSO و در حالتهای مختلفی از جمعیت مرجع، تعداد جایگاههای صفت کمی (QTL) و تراکم نشان گری مقایسه شدند. روشهای بیزی نسبت به روش GBLUP صحت برآورد بالاتری داشتند و این برتری در حالت کم بودن تعداد ژنهای بزرگ اثر و استفاده از اطلاعات جمعیتهای دیگر در تشکیل جمعیت مرجع ایران بیشتر بود. برای انتخاب ژنومی در جمعیت گاوهای هلشتاین ایران، به کارگیری مدل بیز B در جمعیت مرجعی شامل گاوهای نر و ماده و بهرهگیری از اطلاعات جمعیتهای دیگر پیشنهاد میگردد.
Keywords:
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :