بررسی فیلوژنی شترهای تک کوهانه و دو کوهانه ایران براساس توالی ژن ۱۶S rRNA

Publish Year: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 238

This Paper With 9 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_AEJO-12-4_006

تاریخ نمایه سازی: 12 آبان 1400

Abstract:

شتر گونه ­ای بسیار مقاوم در برابر خشکی است که در سخت­ ترین شرایط آب و هوایی، محصولاتی مانند شیر و گوشت تولید می ­کند. با توجه به این ­که تعداد شترهای ایران در حال کاهش است، برای حفظ و بهبود تولیدات این گونه، مطالعات کاربردی ژنتیکی ضروری است. هدف از انجام این مطالعه، بررسی بیوانفورماتیکی و فیلوژنتیکی توالی نوکلئوتیدی ژن ۱۶SrRNA میتوکندریشترهای تک­ کوهانه و دوکوهانه ایرانی بود. در پژوهش حاضر از ۱۰ نمونه شتر دوکوهانه و ۱۰ نمونه شتر تک­ کوهانه مناطق مختلف، نمونه خون جمع آوری شد. پس از استخراج DNA، ژن ۱۶SrRNA میتوکندریایی به طول ۱۵۱۲جفت باز با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر شد. هم ­ردیفی کامل نوکلئوتیدی شترهای تک­ کوهانه و دوکوهانه ایرانی با روش اتوماتیک سانگر صورت گرفت و سپس توالی­ های به ­دست آمده با توالی­ های حاصل از مطالعات دیگر مقایسه شد. نتایج به ­دست آمده نشان داد شباهت نوکلئوتیدی ژن ۱۶SrRNA میتوکندریایی با هم ­ردیفی کامل سایر شترسانان موجود در بانک جهانی ژن ۹۳/۹۸ تا ۱۰۰ درصد محاسبه گردید. مقایسه هم ­ردیفی نوکلئوتیدی، رسم ماتریس فواصل ژنتیکی و رسم درخت فیلوژنتیکی هم ­ردیفی کامل حاصله از آنالیز فاصله ژنتیکی نشان داد که شترهای تک­ کوهانه ایران بیش ­ترین شباهت با شتر تک ­کوهانه عربی و شترهای دوکوهانه ایران بیش ­ترین شباهت با شتر دوکوهانه باختری دارد. هم­ چنین ترسیم این درخت نشان داد که جمعیت شترهای ایرانی یک گروه مونوفیلتیک هستند.

Authors

آزاده ترابی

گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور، تهران، ایران

زهرا رودباری

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه جیرفت، جیرفت، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • ازغندی، م.، ۱۳۹۴. توالی یابی و بررسی بیوانفورماتیکی ژنوم ...
  • رودباری، ز. و نصیری، خ.، ۱۳۹۸. بررسی تنوع ژنتیکی و ...
  • زارعی، ف. و علی ­پناه، ه.، ۱۳۹۲. مقایسه بیوانفورماتیکی چهار ...
  • شهابی، ا. و طهمورث­ پور، م.، ۱۳۹۴. تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی و ...
  • عباسی ­دلویی، ط.؛ سخاوتی، م.ه. و طهمورث ­پور، م.، ۱۳۹۵. ...
  • Aliabadian, M. and Nijman, V., ۲۰۱۲. Mitochondrial sequence divergence suggests ...
  • Agrawal, R.P.; Jain, S.; Shah, S.; Chopra, A. and Agarwal, ...
  • Ahmed, M.M.; El-Shazly, S.A.; Sayed, S.M. and Amer, S.A., ۲۰۱۳. ...
  • Ansari-Renani, H.; Salehi, M.; Ebadi, Z. and Moradi, M.S., ۲۰۱۰. ...
  • Bahbahani, H.; Musa, H.; Wragg, H.; Shuiep, D.; Almathen, E. ...
  • Cui, P.; Ji, R. and Ding, F., ۲۰۰۷. A complete ...
  • Duchemin, S.I.; Colombani, C.; Legarra, A.; Baloche, G.; Larroque, H. ...
  • Hall, T.A. and Carlsbad, C., ۲۰۱۱. BioEdit: important software for ...
  • Hayes, B.J.; Bowman, P.J.; Chamberlain, A.J. and Goddard, M.E., ۲۰۰۹. ...
  • FAO. ۲۰۱۹. Faostat database collections Food and Agriculture Organization of ...
  • Heshmati, G.A. and Squires, V.R., ۲۰۱۳. Combating desertification in Asia, ...
  • Hashim, M.W.; Galal, Y.M.; Ali, M.; Khalafalla, A. and Hamid, ...
  • Ji, R.; Cui, P.; FDing, P.; Geng, H.; Gao, H.; ...
  • Khalkhali-Evrigh, R.; Hafezian, S.H.; Hedayat-Evrigh, N.; Farhadi, A. and Bakhtiarizadeh, ...
  • Lehane, S., ۲۰۱۴. The Iranian water crisis.Future Directions International.http://www. futuredirections.org.au/publication/the-iranian-water-crisis ...
  • Muhire, BM.; Varsani, A. and Martin, D.P., ۲۰۱۴. SDT: A Virus ...
  • Musa, H.; Shuiep, H. and El-Zubeir, E.S., ۲۰۰۶. Camel husbandry ...
  • Patwardhan, A.; Ray, S. and Roy, A., ۲۰۱۴. Molecular markers ...
  • Romli, F.; Abu, N.; Khorshid, F.A.; Syed Najmuddin, S.U.; Keong, ...
  • Ramos-Onsins, S.E. and Rozas, J., ۲۰۰۲. Statistical properties of new ...
  • Brejnev, M.M.; Varsani, A. and Patrick Martin, D., ۲۰۱۴. SDT: ...
  • Tribout, T.; Larzul, C. and Phocas, F., ۲۰۱۲. Efficiency of ...
  • Tsogtgerel, M.B.; Munkhtogtokh, S. and Nansalmaa, L.S., ۲۰۱۷. ۱۶S rRNA ...
  • Tamura, K.; Peterson, D.; Peterson, N.; Stecher, G.; Nei, M. ...
  • Van de Peer, Y., ۲۰۰۹. Phylogenetic inference based on distance ...
  • Lemey, P.;Salemi, M. and Van Damme, A.M., ۲۰۰۹.The phylogenetic handbook: ...
  • نمایش کامل مراجع