شناسایی مولکولی و فیلوژنی گونه Gammarus komareki (Gammaridae) از رودخانه جاجرود با روش بارکدگذاری DNA

گاماروس ها از انواع سخت پوستان ناجورپا متعلق به خانواده Gammaridae بوده که نقش و اهمیت زیادی در زنجیره غذائی، پالایش محیط از مواد آلی و حساسیت بالایی نسبت به آلودگی های محیطی دارند. بنابراین، شناسایی آنها از اهمیت زیادی برخوردار است. از آنجایی که شناسایی جنس گاماروس به دلیل ویژگی های ریخت شناسی شبیه به هم بسیار مشکل می باشد، هدف مطالعه حاضر شناسایی دقیق مولکولی و بررسی روابط فیلوژنی گونه komareki Gammarusاز رودخانه جاجرود در شرق استان تهران در مقایسه با سایر نقاط ایران و جهان بود. بدین منظور، جمع آوری و نمونه برداری با استفاده از تور دستی کوچک از گونه G. komareki رودخانه جاجرود به صورت فصلی از مهر ۱۳۹۲ لغایت تیر ۱۳۹۳ صورت پذیرفت.  به منظور مطالعات مولکولی مقداری بافت از هر نمونه با اسکالپل جدا و در الکل اتیلیک ۹۵ درجه تثبیت گردید. سپس DNA نمونه ها با استفاده از روش CTAB استخراج و قطعه ژنی زیر واحد یک سیتوکروم اکسیداز میتوکندری (COI) تکثیر و توالی یابی شد. پس از تکثیر قطعه ژن و توالی یابی آن، درخت های تبارشناسی Neighbor Joining وMaximum Likelihood با استفاده از نرم افزارهای MEGA۷ ترسیم گردیدند. نتایج مطالعه حاضر نشان داد، اگرچه نمونه های موردنظر از نظر ریخت شناسی متعلق به گونه komareki  Gammarus می باشند که از سایر مناطق ایران گزارش شده است، با این حال بررسی های مولکولی نشان داد نمونه های مطالعه حاضر با قرار گرفتن در دو کلاد مختلف به دو دسته تقسیم شدند. بنابراین، این احتمال وجود دارد که شاید این نمونه ها متعلق به گونه های جداگانه باشند. که اثبات این امر نیازمند بررسی های دقیق تر با سایر نشانگرهای ژنتیکی می باشد.  

Keywords:

Genetic diversity , Gammarus , Jajrood , The east of Tehran , Iran , تنوع ژنتیکی , گاماروس , جاجرود , شرق تهران , ایران