پیشگویی بیوانفورماتیکی ژن های غیرکدکننده مرتبط با ژن های مسیر تمایز اکتودرمی FGF۸، NOG و BMP۴ موشی و ترسیم شبکه ارتباطی آن ها
Publish Year: 1401
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 256
This Paper With 13 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_SHIMU-30-1_004
Index date: 6 April 2022
پیشگویی بیوانفورماتیکی ژن های غیرکدکننده مرتبط با ژن های مسیر تمایز اکتودرمی FGF۸، NOG و BMP۴ موشی و ترسیم شبکه ارتباطی آن ها abstract
مقدمه: lncRNAها و miRNAها دسته ای از RNAهای غیرکدکننده هستند که نقش و عملکردهای مهمی در تنظیم بیان ژن ها و فرایندهای اصلی بیولوژیکی ازجمله تکثیر سلولی، آپوپتوز و تمایز دارند. lncRNAها می توانند به طور بالقوه روی miRNAها، در جهت همسو و یا معکوس بر فعالیتشان تاثیر بگذارند تا از این طریق، نقش تنظیم کنندگی آن ها را تعدیل کنند. در این مطالعه، شبکه های ژنی mRNA-miRNA-lncRNA با استفاده از برنامه های آنلاین برای سه مارکر مسیر اکتودرمی (BMP۴,NOG,FGF۸) در سلول های بنیادی جنینی موشی ترسیم شد.
مواد و روش ها: این مطالعه از نوع تئوریکال بیوانفورماتیکی است و micRNAهای هدف ژن های BMP۴، NOG و FGF۸ توسط پایگاه های داده ای MirWalk و TARGETSCAN استخراج و بررسی گردید تا درنهایت، بتوان miRNAهای مشترک این ۳ ژن را تهیه کرد؛ سپس از پایگاه داده ای DIANA-Tools، lncRNAهای هدف برای miRNAهای مشترک به دست آمد.
یافته ها: ژن های mmu-miR-۹۲a-۲-۵p، mmu-miR-۱۲۹b-۵p، mmu-miR-۱۳۰b-۵p، mmu-miR-۶۹۲، mmu-miR-۷۰۰۹-۳P، mmu-miR-۷۱۱۶-۳p و mmu-miR-۷۶۸۹-۳p ممکن است بر فعالیت lncRNA های Kcnq۱ot۱، Gm۲۶۸۱۲، Gm۴۱۱۷، Gm۱۱۸۳۷.۴۹۳۰۴۲۳MO۲Rik، Malat۱، Gm۱۲۵۹۴، Gm۳۴۱۴.۵۸۳۰۴۴۴B۰۴Rik، Gm۲۴۶۴ و NEAT۱ اثر بگذارند.
بحث و نتیجه گیری: با توجه به ارتباط متقابل lncRNA، miRNA و mRNA، مطالعه ما یک نقش جدید از lncRNAها را برای تحقیقات آینده و مطالعات تجربی درباره مسیر تمایز اکتودرمی و سازوکار های مولکولی فراهم می کند.
پیشگویی بیوانفورماتیکی ژن های غیرکدکننده مرتبط با ژن های مسیر تمایز اکتودرمی FGF۸، NOG و BMP۴ موشی و ترسیم شبکه ارتباطی آن ها Keywords:
پیشگویی بیوانفورماتیکی ژن های غیرکدکننده مرتبط با ژن های مسیر تمایز اکتودرمی FGF۸، NOG و BMP۴ موشی و ترسیم شبکه ارتباطی آن ها authors
سمیه مقدم
Dept of Animal Biology, School of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran
اسمائیل بابایی
Dept of Animal Biology, School of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :