بررسی خصوصیات ساختاری و فیلوژنی پروتئین سیتوکروم P۴۵۰ در حشرات
Publish place: Journal of applied plant protection، Vol: 4، Issue: 4
Publish Year: 1394
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 155
This Paper With 13 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_PLNTI-4-4_003
تاریخ نمایه سازی: 29 تیر 1401
Abstract:
آنزیمهای سیتوکروم P۴۵۰ (cyps) منواکسیژنازهای حاوی هم هستند که در متابولیسم مواد داخلی و خارجی دخالت دارند. آنها شامل یک بالاخانواده از آنزیمها هستند که در موجودات مختلف مانند پستانداران، گیاهان، باکتریها و حشرات یافت میشوند. cyp ها متنوع بوده و سوبستراهای زیادی را متابولیزه میکنند، اما ساختار آنها بسیار حفاظت شده است. در این مطالعه، تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی آنزیمهای P۴۵۰ در سی گونه از حشرات متعلق به خانوادههای مختلف انجام گرفت. بر اساس موتیفهای به دست آمده از ابزارهای MEME و MAST، ۳ موتیف در تمام حشرات مشترک بود. آنالیز ساختاری هفت گونه از حشرات انتخاب شده توسط ابزارهای ProtParam و SOPMA در پایگاه EXPASY انجام شد. ساختار سوم Drosophila melanogaster (شماره دسترسی: NP_۵۲۵۰۳۱) به عنوان حشره نمونه و شش گونه دیگر با استفاده از سرور Phyre۲ و با استفاده از مدل “c۴lxjA” (کد دسترسی: ۴lxj) پیشبینی گردید. توالی پروتئینها با استفاده از الگوریتم ClustalW توسط نرم افزار MEGA ۶.۰۶ همترازسازی شده و درخت فیلوژنی با استفاده از روش اتصال-همسایگی (NJ) ترسیم گردید. با توجه به نتایج، شباهت زیادی بین پروتئینهای cyp در گونههای مختلف حشرات وجود دارند بهطوریکه احتمالا از یک جد مشترک مشتق شدهاند. دادههای بهدست آمده پیش زمینهای را برای مطالعات بیوانفورماتیکی راجع به عملکرد و تکامل این پروتئین در حشرات فراهم میآورد.
Keywords:
Authors
ثمین صدیق
استادیار، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد ورامین-پیشوا، دانشکده کشاورزی، گروه گیاهپزشکی، ورامین، ایران