آنالیزفیلوژنتیکی جمعیتی از گوسفند افشاری با استفاده از توالی HVR-IوcytB میتوکندریDNA

سابقه و هدف: در بین نشانگرهای ژنتیکی، توالییابی ژنوم میتوکندری یکی از بهترین و رایج ترین روشها برای طبقهبندی ژنتیکی جمعیتها و گونه های نزدیک به هم، بررسی امکان اشتقاق گونه های مختلف از یک جد مشترک، مطالعه رابطه فیلوژنی هر موجود با سایر گونه ها و نژادها و دستیابی به راهکارهایی برای حفظ ذخایر ژنتیکی میباشد. هدف از این تحقیق تعیین توالی ناحیه HVR۱ و CytB از ژنوم میتوکندری گوسفند افشاری میباشد. مواد و روشها: برای انجام این تحقیق تعداد ۴۰ نمونه خون از هر دو جنس از گوسفندان غیر خویشاوند افشاری جمعآوری شد. پس از استخراج DNA، ناحیه HVR۱ و CytB توسط پرایمرهای اختصاصی تکثیر شده و تعیین توالی شدند. توالی های به دست آمده با استفاده از برنامه Chromas Lite ۲.۰۱ تجزیه و تحلیل شد. جهت تعیین بالاترین همولوژی توالی گوسفند افشاری از رویه Blast تحت پایگاه NCBI استفاده شد.یافته ها: پس از تعیین توالی، با مقایسه توالی CytB و HVR۱ از ژنوم گوسفند افشاری با توالی ناحیه مشابه از ژنوم گوسفندان سایر نژادها از مناطق مختلف جهان به ترتیب ۳ هاپلوتیپ و ۵ هاپلوتیپ مشاهده شد. علاوه بر این هر دو مقر دارای چندشکلی بالایی بودند.نتیجه گیری: تعیین توالی ژنوم میتوکندری به خوبی می تواند تنوع ژنتیکی و ارتباط خویشاوندی گونه های مختلف گوسفندان را نشان دهد. لذا ابزار قدرتمندی است که می تواند برای بررسی تنوع ژنتیکی سایر نژادهای گوسفندی مورد استفاده قرار گیرد.

Keywords:

DNAمیتوکندری , ناحیه HVR۱ و CytB , تعیین توالی , فیلوژنی , گوسفند افشاری