جداسازی، شناسایی مولکولی و آنالیز فیلوژنتیکی اکتینومیست های مولد مواد ضدمیکروبی علیه پاتوژن های بیماری زا از خاک های زراعی شور شهر قم

زمینه و هدف: اکتینومیست ها، باکتری های گرم مثبت و رشته ای هستند که بخش اعظم میکروارگانیسم های خاک را دربرمی گیرند. براساس مطالعات انجام شده، سه چهارم از کل آنتی بیوتیک های شناخته شده را اکتینومیست ها تولید می کنند. مطالعه حاضر با هدف بررسی اکتینومیست های مناطق مختلف استان قم از جهت خواص آنتی باکتریایی صورت گرفت. روش بررسی: در این مطالعه بنیادی، ابتدا اکتینومیست ها از خاک های زراعی شور استان قم جداسازی شدند، سپس غربالگری اولیه به روش کشت و غربالگری ثانویه با روش انتشار در آگار در برابر باکتری های بیماری زا انجام گرفت. جهت شناسایی مولکولی، DNA ژنومیک تمام جدایه ها استخراج شد، سپس ژن SrRNA۱۶ آن ها با تکنیک PCR، تکثیر و نمونه های مثبت سکانس شدند و نتایج حاصله، از نظر فیلوژنتیک بررسی گردید. یافته ها: در این مطالعه از ۱۰۰ نمونه خاک جمع آوری شده، ۲۳ ایزوله اکتینومیست جدا شد. همچنین علاوه بر تست های میکروب شناسی، ۱۰ نمونه با استفاده از روش PCR براساس ژن SrRNA۱۶ توالی یابی شدند که ایزوله ها با میزان ۱۰۰ و ۹۹% به جنس استرپتومیست و اکتینومیست مشابهت داشتند. نیتجه گیری: نتایج این مطالعه نشان داد ایزوله های جدیدی در نمونه خاک استان قم وجود دارد که توانایی تولید مواد آنتی باکتریایی جدید را دارند و می توان از آن ها در حوزه صنعت استفاده کرد.

Keywords:

Actinomycetes , Soil , Polymerase Chain Reaction , Qom , Molecular detection , Phylogenetic analysis , Qom , Iran. , اکتینومیست , خاک , واکنش زنجیره ای پلیمراز , , بررسی مولکولی , آنالیز فیلوژنتیکی , قم , ایران