طراحی و بهینه سازی تست PCR برای تشخیص سریع پاتوتایپ های انترواگریگیتیو و انتروتوکسی ژنیک اشرشیاکلی
Publish place: Qom University of Medical Sciences، Vol: 10، Issue: 10
Publish Year: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 203
This Paper With 9 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_MUQ-10-10_004
تاریخ نمایه سازی: 21 مهر 1401
Abstract:
زمینه و هدف: اشرشیاکلی به عنوان یکی از مهم ترین عوامل ایجادکننده بیماری اسهالی حاد در دنیا مطرح است. بیماری های اسهالی یکی از علل اصلی مرگ و میر در میان کودکان کشورهای درحال توسعه می باشند. این مطالعه با هدف توسعه تکنیک PCR برای تشخیص اختصاصی ژن های ویرولانس پاتوتایپ های انترتوکسی ژنیک اشرشیاکلی (ETEC) و انترواگریگیتیو و اشرشیاکلی (EAEC) انجام شد.
روش بررسی: در این مطالعه برای تشخیص پاتوتایپ ها ETEC-EAEC، از ژن های اختصاصی st و lt (برای تشخیص پاتوتایپ ETEC) و از ژن اختصاصی aafII (برای شناسایی پاتوتایپ EAEC) استفاده شد. این تکنیک PCR برای این سه ژن طراحی و بهینه گردید. محصولات واکنش برای هریک از این ژن ها، در وکتور pTZ۵۷R/T به عنوان کنترل مثبت، کلون و مورد استفاده قرار گرفت. میزان حساسیت پرایمر ها با محاسبه کمترین میزان تشخیص (Limit of Detection) و استفاده از ژنوم سایر باکتری ها به عنوان بررسی اختصاصیت پرایمر ها ارزیابی شد.
یافته ها: با توجه به نتایج آنالیز محصولات PCR بر روی ژل الکتروفورز باند های مورد نظر برای ژن aafII، lt و st به ترتیب ۳۸۴ ، ۴۵۹ و ۱۵۰ جفت باز به دست آمد. همچنین واکنش ژنوم باکتری های کنترل با پرایمر های طراحی شده، منفی بود. حد تشخیص براساس تعداد کپی برای ژن های st، lt و aafII به ترتیب برابر ۳۹۰ ، ۱۵۰۰ و ۲۵۰۰ کپی به دست آمد.
نتیجه گیری: با توجه به نتایج این مطالعه، طراحی این گونه تست ها در ایران به عنوان یک پیشرفت در زمینه بهبود تشخیص سریع و دقیق پاتوژن ها و تفکیک در نوع پاتوتایپ های اشرشیاکلی می باشد.
Keywords:
Escherichia coli , Polymerase chain reaction , Dysentery , اشرشیا کلی , واکنش زنجیره ای پلیمراز , اسهال
Authors
محمد سلیمانی
Qom Branch, Islamic Azad University
عباس مروتی
Qom Branch, Islamic Azad University
علی جوادی
Tehran University of Medical Sciences
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :