بررسی بیوانفورماتیکی تاثیر ترکیبات گیاهی موجود در گیاهان دارویی Ferulago angulat، Scrophularia striata و Laurus nobilis در مهار پروتئین های موثر در بروز مقاومت آنتی بیوتیکی در استافیلوکوکوس اورئوس: یک مطالعه توصیفی
Publish Year: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 172
This Paper With 16 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_RUMS-18-2_007
تاریخ نمایه سازی: 25 دی 1401
Abstract:
چکیده
زمینه و هدف: اخیرا عفونتهای ناشی از استافیلوکوکوس اورئوس (Staphylococcus aureus; S. aureus) و ایجاد جدایه های مقاوم به آنتی بیوتیکها افزایش یافته است. بنابراین مطالعات فراوانی به منظور معرفی ترکیبات جدید با فعالیت ضد S. aureus بهویژه ترکیباتی با منشاء طبیعی جهت مقابله با گونههای مقاوم به آنتی بیوتیک انجام گرفته است. هدف از این مطالعه تعیین غربالگری بیوانفورماتیکی مهارکنندههای نوین پروتئینهای مرتبط با بروز مقاومت آنتیبیوتیکی موجود در گیاهان دارویی بود.
مواد و روشها: در این مطالعه توصیفی، ابتدا ساختار سه بعدی ترکیبات فیتوشیمیایی موجود در سه گیاه دارویی Ferulago angulat، Scrophularia striata و Laurus nobilis از پایگاه داده PubChem دریافت شد. سپس ساختار سه بعدی چهار پروتئین مرتبط با بروز مقاومت آنتیبیوتیکی شامل β-lactamase، پروتئین متصل شونده به پنی سیلین a۲ (a۲PBP)، ونکومایسین A (VanA) و D-آلانیل D-آلانین دی پپتیداز (VanX) به کمک پایگاه دادههای پروتئین به دست آمد. در نهایت، توانایی ترکیبات شیمیایی انتخاب شده جهت مهار پروتئینهای مرتبط با مقاومت آنتی بیوتیکی مذکور با استفاده از روش داکینگ مولکولی بهوسیله نرم افزار ۱. ۲iGemdock بررسی شد.
یافته ها: نتایج نشان داد که اکثر ترکیبات مورد بررسی، برهمکنشهای مناسبی با تمامی پروتئینهای مورد مطالعه به ویژهVanX دارند. نتایج همچنین نشان داد که دو ترکیب Phthalate (ethylhexyl-۲)Bis و Palmitic acid قویترین برهمکنشها را با تمامی پروتئینهای مورد بررسی دارند.
نتیجهگیری: نتایج این مطالعه نشان داد که که دو ترکیب Phthalate (ethylhexyl-۲)Bis و Palmitic acid موجود در گیاهان دارویی بررسی شده کاندیدهای مناسبی برای مطالعات برون تنی و درون تنی مرتبط با فعالیت ضد S .aureus مقاوم به آنتیبیوتیک میباشند.
واژههای کلیدی: استافیلوکوکوس اورئوس، مقاومت آنتی بیوتیکی، گیاهان دارویی، بیوانفورماتیک
Keywords:
Authors
زینب شاکران
department of biology, faculty of science, University of Isfahan
زهرا شاکران
Department of Biotechnology, Faculty of advanced science and technologies, University of Isfahan
مختار نصرتی
Department of Biotechnology, Faculty of advanced science and technologies, University of Isfahan
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :