Molecular phylogeny of the genus Sanguisorba from Iran: Evidence based on cpDNA and nrDNA sequencing analysis

Publish Year: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: English
View: 139

This Paper With 14 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ROST-23-67_003

تاریخ نمایه سازی: 3 اسفند 1401

Abstract:

In this research, the molecular phylogeny of the genus Sanguisorba including two species (S. officinalis and S. minor), and the three subspecies (S. minor subsp. muricata, S. minor subsp. lasiocarpa, and S. minor subsp. minor) were studied from Iran using nrDNA ITS and cpDNA rpl۳۲-trnL(UAG). For this purpose, ۲۶ taxa, comprising four Iranian samples plus ۲۲ previously sequenced data received from GenBank were analyzed. The phylogenetic relationships were reconstructed within Sanguisorba using maximum parsimony and Bayesian analyses. The results of nuclear sequence analysis showed separation of two subfamilies (Agrimoniinae and Sanguisorbinae), monophyly of Sanguisorba, complete separation of S. officinalis (in Sanguisorba clade) from S. minor and the three subspecies (in Poterium clade). Although, the intraspecific relationship remained unresolved, but it was found that, the use of micro- and macromorphological criteria could be used as an important tool in different taxonomic ranks, especially in intraspecific identification. In addition, average sequence divergence, genetic differentiation, morphological, and micromorphological evidence are discussed.

Authors

مرضیه بیگم فقیر

Associate Prof., Department of Biology, Faculty of Science, University of Guilan, Rasht, ۴۱۹۳۸-۳۳۶۹۷, Iran

عادله دیلمی معزی

MSc Student, Department of Biology, Faculty of Science, University of Guilan, Rasht, ۴۱۹۳۸-۳۳۶۹۷, Iran

ربابه شاهی شاوون

Assistant Prof., Department of Biology, Faculty of Science, Yasouj University, Yasouj, ۷۴۹۳۴-۷۵۹۱۸, Iran

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Amirahmadi, A., Kazempour-Osaloo, S., Kaveh, A., Maassoumi, A.A. & Naderi, ...
  • Álvarez, I. & Wendel, J.F. ۲۰۰۳. Ribosomal ITS sequences and ...
  • Ascherson, P. & Graebner, P. ۱۹۰۲. Tribus Sanguisorbeae. Synopsis der ...
  • Bailey, L.H. ۱۹۴۹. Sanguisorba L. Manual of Cultivated Plants. Revised. ...
  • Bentham, G. & Hooker, J.D. ۱۸۶۵. Genera Plantarum. Reeve & ...
  • Bertoloni, A. ۱۸۳۵. Flora Italica. Volume. ۲, Ex typographaeo Richardi ...
  • Brown, A. & Bouche, C. ۱۸۶۷. Sanguisorba. Index seminum horti ...
  • Chung, K.S., Elisens, W.J. & Skvarla, J.J. ۲۰۱۰. Pollen morphology ...
  • Daylami Moezi, A.D., Faghir, M.B. & Shahi, R.S. ۲۰۱۹. Flower ...
  • Dobeš, C. & Paule, J. ۲۰۱۰. A comprehensive chloroplast DNA-based ...
  • Drummond, A.J., Rambaut, A. ۲۰۰۷. Bayesian evolutionary analysis by sampling ...
  • Edgar, R.C. ۲۰۰۴. Multiple sequence alignment with high accuracy and ...
  • Eriksson, T., Donoghue, M.J. & Hibbs, M.S. ۱۹۹۸. Phylogenetic analysis ...
  • Eriksson, T., Hibbs, M.S., Yoder, A.D., Delwiche, C.F. & Donoghue, ...
  • Faghir, M.B., Chaichi, K.K. & Shahvon, R.S. ۲۰۱۴. Foliar epidermis ...
  • Faghir, M.B., Ashori, F. & Mehrmanesh, A. ۲۰۱۷. Comparative leaf ...
  • Felsenstein, J. ۱۹۸۵. Confidence limits on phylogenies: An approach using ...
  • Focke, W.O. ۱۸۸۸. Rosaceae. Pp. ۱–۶۱. In: Engler, A. & ...
  • Gremli, A. ۱۸۶۷. Beiträge zur Flora von Schaffhausen. Oesterreichische botanische Zeitschrift ...
  • Hall, R.E. ۲۰۰۱. The stock market and capital accumulation. The ...
  • Hebda, R.J. & Chinnappa, C.C. ۱۹۹۰. Studies on pollen morphology ...
  • Helfgott, D.M., Francisco-Ortega, J., Santos-Guerra, A., Jansen, R.K. & Simpson, ...
  • Hutchinson, J. ۱۹۶۴. The Genera of Flowering Plants. Dicotylédones. Vol. ...
  • Juzepczuk, S.W. ۱۹۴۱. Rosaceae-Rosoideae, Prunoideae. Pp. ۵۳۴. In: Komarov, V.L. ...
  • Kerr, M.S. ۲۰۰۴. A phylogenetic and biogeographic analysis of Sanguisorbeae ...
  • Kalkman, C. ۲۰۰۴. Rosaceae. Pp. ۳۴۳–۳۸۶. In: Kubitzki, K. (ed.), ...
  • Khatamsaz, M. ۱۹۹۳. Flora of Iran. Rosaceae. Research Institute of ...
  • Kumar, S., Stecher, G. & Tamura, K. ۲۰۱۶. MEGA۷ molecular ...
  • Larkin, M.A., Blackshields, G., Brown, N.P., Chenna, R., McGettigan, P.A., ...
  • Miller, M.A., Pfeiffer, W. & Schwartz, T. ۲۰۱۰. Creating the ...
  • Mishima, M., Ohmido, N., Fukui, K. & Yahara, T. ۲۰۰۲. ...
  • Morgan, D.R., Soltis, D.E. & Robertson, K.R. ۱۹۹۴. Systematic and ...
  • Nordborg, G. ۱۹۶۶. Sanguisorba L., Sarcopoterium Spach. and Bencomia Web. ...
  • Nordborg, G. ۱۹۶۷. The genus Sanguisorba section Poterium. Experimental studies ...
  • Nordborg, G. ۱۹۶۹. Sanguisorba L. (Rosaceae). Pp. ۱۵۲–۱۵۵. In: Rechinger, ...
  • Potter, D., Eriksson T., Evans, R.C., Oh, S., Smedmark, J.E.E., ...
  • Purohit, K.M. & Panigrahi, G. ۱۹۸۴. The genus Sanguisorba (Rosaceae) ...
  • Ronquist, F., Teslenko, M., Mark, P.V.D, Ayres, D.L., Darling, A., ...
  • Rydberg, P.A. ۱۹۰۸. North American flora. Vol. ۲۲. [Rosales]: Pt. ...
  • Schönbech-Temesy, E. ۱۹۶۹. Agrimonia (Rosaceae). Pp. ۱۴۸–۱۵۲. In: Rechinger, K.H. ...
  • Schulze-Menz, G.K. ۱۹۶۴. Rosales. Pp. ۱۹۳–۲۴۲. In: A. Engler’s Syllabus ...
  • Scopoli, I.A. ۱۷۷۲. Flora Carniolica ۲, Vienna, ۱۱۰ pp ...
  • Shahi Shavvon, R., Kazempour Osaloo, S., Maassoumii, A.A., Moharrek, F., ...
  • Shaw, J., Lickey, E.B., Schilling, E.E. & Small, R.L. ۲۰۰۷. ...
  • Shaw, J., Shafer, H.L., Leonard, O.R., Kovach, M.J., Schorr, M. ...
  • Spach, E. ۱۸۴۶. Revisio generis Poterium. Annles des Sciences Naturelles ...
  • Sang, T., Crawford, D.J. & Stuessy, T.F. ۱۹۹۵. Documentation of ...
  • Swofford, D.L. ۲۰۰۲. PAUP phylogenetic analysis using parsimony, version ۴.۰ ...
  • Takhtajan, A. ۱۹۹۷. Diversity and Classification of Flowering Plants. Columbia ...
  • Tantawy, M.E. & Naseri, M.M. ۲۰۰۳. A contribution to the ...
  • Thomas, M.K., Lloyd-Jones, D.M., Thadhani, R.I., Shaw, A.C., Deraska, D.J., ...
  • Yang, J.H., Hwang, Y.H., Gu, M.J., Cho, W.K. & Ma, ...
  • White, T.J., Bruns, T., Lee, S.J.W.T. & Taylor, J. ۱۹۹۰. ...
  • Wu, J.M., Hundley, A.F. & Visco A.G. ۲۰۰۵. Elective primary ...
  • Xiang, Y., Huang, Ch., Hu, Y., Wen, J., Li, S., ...
  • Zhang, L., Koyyalamudi, S.R., Jeong, S.C., Reddy, N., Smith, P.T., ...
  • Zhang, S.D., Jin, J.J., Chen, S.Y., Chase, M.W., Soltis, D.E., ...
  • نمایش کامل مراجع