طراحی مولکولی نانوذرات طلا کونژوگه شده با مولکول های سیالیک اسید الگو گرفته شده از طبیعت و بررسی برهمکنش آن با پروتئین سنبله ویروس SARS-CoV۲ با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی و روش تجربی

مقدمه: امروزه، عملکرد ویژه نانوذرات خاص در کامپیوتر اهمیت پیدا کرده است.هدف: هدف از این تحقیق طراحی مولکولی نانوذرات طلا کونژوگه شده با مولکول های سیالیک اسید و بررسی برهمکنش آن با پروتئین سنبله ویروس SARS-CoV۲ با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی بود.روش اجرای تحقیق: در این تحقیق ابتدا در کامپیوتر نانوذرات طلا کونژوگه شده با مولکول های اسید سیالیک را با استفاده از نرم افزارهای Hyperchem، Ascalaph Designer و دیتابیس PUBCHEM طراحی و برهمکنش آن با پروتئین S ویروس COVID-۱۹ با استفاده از نرم افزار آنلاین HDOCK بررسی و با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی پایداری آن اثبات گردید.نتایج: این مطالعه ثابت کرد که نانوذرات طلای کونژوگه شده با اسید سیالیک توانایی متصل شدن به پروتئین S مدل شده را دارد. در این مطالعه انرژی داکینگ پروتئین S با نانوذرات طلا کونژوگه شده با اسید سیالیک ۱۸۳- کیلوکالری بر مول با ۳۱RMSD آنگستروم شد. شبیه سازی دینامیک مولکولی نیز پایداری این تعامل را اثبات کرد.بحث و نتیجه گیری: در کل می توانیم نتیجه بگیریم برای تشخیص ویروس COVID-۱۹ می توانیم از نانوذرات طلای کونژوگه شده با اسید سیالیک،بجای آنتی بادی استفاده کنیم. البته برای اثبات کردن این ایده تست های مختلف دیگری هم باید انجام دهیم که در آینده مد نظر قرار خواهد گرفت.

Keywords:

طراحی مولکولی , نانوذرات طلا , اسید سیالیک , پروتئین S , شبیه سازی دینامیک مولکولی