مطالعه ی بیوانفورماتیکی و تجربی بیان ژن های UBE۲Wو SSX۲IP در سلول های سرطانی HepG۲ تیمار شده با ملاتونین

سابقه و اهداف:  هدف از مطالعه حاضر ارزیابی بیوانفورماتیکی و تجربی تاثیر ملاتونین بر بیان ژن­های UBE۲W  و SSX۲IP در رده سلولی HepG۲ تیمار شده با داروی ملاتونین می­باشد. UBE۲W پروتئینی را رمزگذاری می کند که باعث افزایش یوبی­کویتینه شدن پروتئین­های گروه مکمل آنمی فانکونی شده و ممکن است در ترمیم آسیب DNA مهم باشد. SSX۲IP متعلق به سیستم اتصال سلولی است که در حرکت سلول دخیل است و به عنوان یک عامل بلوغ سانتروزوم عمل می کند. مواد و روش­ها: در ابتدا، نرم افزار MATLAB ۲۰۱۸a برای ارزیابی میزان بیان ژن­های  UBE۲W  و SSX۲IP از داده­های میکرو آرایه مورد استفاده قرار گرفت. سپس، بعد از طراحی و تهیه پرایمرها، آزمایشات تجربی شامل تست MTT و Real-time PCR انجام گرفت. یافته ها: نتیجه تست MTT نشان داد که زنده مانی سلول مورد مطالعه در گروه تیمار شده با ملاتونین بصورت معنی داری کاهش می یابد و میزان IC۵۰ برای ۴۸ ساعت برابر ۴۵۰ میکرومولار تخمین زده شد. نتایج Real-time PCR  ثابت کرد که میزان بیان هر دو ژن مورد مطالعه در سلول­های تیمار شده با ملاتونین در مقایسه با گروه شاهد افزایش ( غیر معنی­دار p≥ ۰.۰۵ در ۲۴ ساعت و معنی­دار p≤۰.۰۵ در ۴۸ ساعت) می یابد که هم­ راستا با نتایج آنالیز بیوانفورماتیکی می­باشد. استنتاج: نتایج این مطالعه نشان می­دهد که UBE۲W  و  SSX۲IP می­توانند به عنوان ژن هدف در درمان هپاتوسلولار کارسینوما به کار گرفته شود، اگر چه برای تایید این نتایج نیاز به انجام مطالعات گسترده می­باشد.

Keywords:

melatonin , Hepatocellular carcinoma , bioinformatics , microarray data , ملاتونین , کارسینومای هپاتوسلولار , بیوانفورماتیک , داده های میکرو آرایه