مقایسه ماتریس های روابط خویشاوندی ژنومی متفاوت در پویش ژنومی وزن دهی شده چند جمعیتی

هدف از پژوهش حاضر، انتخاب بهترین ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی برای پویش ژنومی چندجمعیتی است. ساختار ژنتیکی جمعیت­ها منحصر به فرد هستند، بنابراین برای تشکیل ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی چند جمعیتی از ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی بلوک­بندی شده استفاده می شود. در این مطالعه، ابتدا دو جمعیت با ساختار ژنتیکی متفاوت شبیه­سازی شدند. سپس ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی معمولی (G)، ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی بلوک­بندی شده (BG) و ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی بلوک­بندی وزن­دهی شده با واریانس ژنوتیپی برآورد شده با بیز B (WBG) برای حیوانات تشکیل شدند و برای مطالعات پویش ژنومی تک مرحله­ای استفاده شدند. علاوه بر آن، با روش بیزB پویش ژنومی انجام شد و با پویش های ژنومی تک مرحله­ای مقایسه شدند. نتایج پویش ژنومی با استفاده از ماتریس­های روابط خویشاوندی G، BG و WBG نشان داد که به طور میانگین به ترتیب ۱۴، ۱۶، ۲۱ نشانگر ژنومی مرتبط با QTL های صفات شناسایی شدند که واریانس ژنتیکی توجیه شده بالای یک درصد دارند. همچنین با استفاده از روش آماری بیز B تنها دو نشانگر ژنومی با واریانس بالای یک درصد شناسایی شدند. علاوه براین، میانگین صحت­های پیش­بینی ارزش اصلاحی ژنومی در لحظه هم­گرایی با استفاده از ماتریس­های G، BG و WBG به ترتیب ۳۶/۰، ۳۹/۰، ۴۳/۰ برآورد شدند. نتیجه گیری کلی نشان­داد که استفاده از ماتریس­های روابط خویشاوندی ژنومی BG و WBG می­تواند باعث بهبود پویش ژنومی چندجمعیتی یا چندنژادی شود.

Keywords:

بیزB , پویش ژنومی چند جمعیتی , ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی بلوکی , ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی