بررسی ژن ها و microRNA های دخیل در مقاومت دارویی چندگانه در درمان سرطان پستان سه گانه منفی

مقدمه: شیوع مقاومت دارویی در تمام اشکال سرطان سینه، به خصوص در سرطان سینه سه بار منفی(TNBC)، یکی از چالشهای بسیاری است که مدیریت این بیماری با تمام پیشرفتهایی که داشته هنوز با آن مواجه است.روش ها: مطالعه کنونی با هدف بررسی ژنها و میکروآرانهایی که در مقاومت چند دارویی در درمان سرطان سینه نقش دارند، با استفاده از رویکردهای بایوانفورماتیک، به منظور معرفی هدفهای درمانی مناسب و همچنین بیونمایگرهای پیشبینی و درمان با استفاده از دیتاستهای GSE۴۵۸۹۸ و GSE۴۷۹۹۴از پایگاه داده Gene Expression Omnibus (GEO) که نمونه های تومور مقاوم و پاسخدهنده را شامل میشود، صورت گرفت. آنالیزهای بعدی با استفاده از زبان کامپیوتر R و بسته های مرتبط مانند Limmaانجام شد. سایت KEGG FunRich برای انجام تحلیل انتولوژی ژن و شناسایی شبکه های سیگنالدهیKEGGو انتخاب ژنهایی با بیان تغییر یافته (DEGs) بر اساس معیار p.value <۰.۰۵ استفاده شد. علاوه بر این، میکروآرانهایی که با DEGs های کشف شده ارتباط داشتند، با استفاده از پکیج MIRSystem پیدا شدند. همچنین، شبکه تعامل پروتئین-پروتئین (PPI) و ارتباط بین ژنهای کشف شده و میکروآران تنظیم کننده آنها با استفاده از برنامه Cytoscape و STRING مشخص گردیدند. نتایج: به طور کلی، در دیتاست GSE۴۵۸۹۸، ۳۱۲ ژن ۲۴۰) ژن با بیان بیشتر و ۷۲ ژن با بیان کمتر) و در دیتاستGSE۴۷۹۹۴ ، ۴۱۱ ژن ۷۴) ژن با بیان بیشتر و ۳۳۷ ژن با بیان کمتر) شناسایی شد. تحلیلهای بعدی نشان داد که این ژنها در شبکه های ارتباطی متعددی شامل انتقال اپیتلیال به مزنکیمال (EMT) نیز نقش دارند.نتیجه گیری: در نتیجه، با استفاده از پیشرفت های بایوانفورماتیکی برای اهداف درمانی و شناسایی زودهنگام این نوع تومور، این کار با باز کردن درب تحقیقات اضافی، با افشای تعداد زیادی از ژنها و میکرو آرانهای رابطهدار با فرآیند مقاومت در درمان TNBC، صورت گرفته است.

Keywords:

سرطان پستان , سرطان پستان سه گانه منفی , میکروآرانها , بیومارکر.