بررسی نظری داکینگ مولکولی و عملکرد آن

امروزه با پیشرفت فناوری و بکارگیری روش های نوین در امور مختلف علمی و به ویژه استفاده از رایانه ها و روش های In silico ، داکینگ مولکولی را به یکی از پرکاربرد ترین روش ها برای طراحی دارو ، واکسن و ترکیبات جدید و یا بررسی برهم کنش های شیمیایی تبدیل کرده است . داکینگ مولکولی یک روش پر استفاده در زمینه شناسایی تعاملات مولکولی است که امکان تعیین ساختار یکپارچه مولکول ها را فراهم می کند. در این روش ، دو مولکول لیگاند و گیرنده با توجه به ساختار و ویژگی های شیمیایی شان و تحت الگوریتم های مشخصی به یکدیگر متصل می شوند و تعاملات بین آن ها مورد بررسی قرار می گیرد. به طور کلی داکینگ مولکولی از دو مرحله عمده تشکیل شده است که شامل : الگو های نمونه برداری و توایع امتیازدهی می باشد که هر کدام شامل الگوها و توابع ریز تری نیز می باشند . از جمله فواید داکینگ مولکولی می توان به امکان پیش بینی تعاملات مولکولی ، طراحی داروهای جدید و بهبود دانش و فهم ما از فرآیندهای بیولوژیکی اشاره کرد. این روش به سرعت در حال پیشرفت و استفاده گسترده است و در تحقیقات زیست شیمیایی و داروسازی از اهمیت زیادی برخوردار است .

Keywords:

تعاملات مولکولی , داکینگ مولکولی , کشف دارو , گیرنده , لیگاند