بررسی اتصال کمپلکس مس به پروتئین بتالاکتوگلوبولین با روش داکینگ مولکولی

بتالاکتوگلوبولین از پروتئین های اصلی آلرژن شیر گاو می باشد، در شیر انسان یافت نمی شود و مقاومتش به پروتئازها سبب می شود که به طور کامل تجزیه نشده، اپی توپ ها به صورت آنتی ژن جذب شده و سیستم ایمنی را فعال نمایند. کمپلکس فلزی در واقع تقلیدی از مکان فعال آنزیم است که در آن فلز به کمک گروه های عاملی، عمل کاتالیز را انجام می دهد. در این پروژه اتصال کمپلکس مس به پروتئین بتالاکتوگلوبولین با روش داکینگ مولکولی و با استفاده از اتوداک ۴ بررسی گردید. ساختار کمپلکس بوسیله کمدراو رسم گردید و سپس بوسیله گوسین بهینه گردید. ساختار نهایی برهمکنش پروتئین با کمپلکس با روش بهینه سازی AutoDock Tools انجام شد. نتایج نشان می دهد که کمپلکس مس با اتصال به مکان اپی توپ های ۱ و ۲ موجب پوشیده شدن توالی ها و عدم شناسایی آنها توسط سیستم ایمنی می گردند. یافته های بدست آمده نشان می دهد کمپلکس مس طراحی شده یا قوی ترین اتصال به مکان اپی توپ دو را نشان می دهد. پوشانده شدن این محل بوسیله کمپلکس های مس یکی از دلایل کاهش حساسیت زایی پروتئین بتالاکتوگلوبولین پس از تیمار با کمپلکس مس است. همچنین نتایج انرژی آزاد بدست آمده نشان می دهد برهمکنش های هیدروفوب در اتصال کمپلکس ها نقش اصلی را دارند.

Keywords:

بتالاکتوگلوبولین , کمپلکس مس , داکینگ مولکولی