بررسی مسیرهای سیگنالی دخیل در تقابل عفونت ویروس های فرصت طلب با سلول های لنفوسیت T کمکی
Publish Year: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 59
This Paper With 13 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JHBMI-10-3_001
تاریخ نمایه سازی: 8 مرداد 1403
Abstract:
مقدمه: افرادی که سیستم ایمنی ضعیفی دارند سریع تر به عفونت های فرصت طلب (OIs) مبتلا می شوند. یافتن ارتباط ویروس ها و مسیر های سیگنالی مرتبط با عفونت های این ویروس ها مثل اپشتین بار ویروس (EBV ) و سایتو مگالو ویروس ( CMV ) نقش قابل ملاحظه ای در بررسی ارتباط آن ها با سلول های لنفوسیت T کمکی دارند. در این مطالعه با استفاده از آنالیز بیوانفورماتیک به بررسی و کاندید نمودن ژن های موجود در مسیرهای وابسته به عفونت ویروس های فرصت طلب با سلول های لنفوسیت T کمکی پرداخته شد.
روش: در این مطالعه با مراجعه به پایگاه داده GEO دیتاست مناسب برای آنالیز انتخاب گردید. این دیتاست شامل پروفایل بیان ژنی در عفونت ویروس های EBV و CMVبود. کلاسترهای ژنی با بیان بالا و پایین دسته بندی شدند. برای ارزیابی دقیق تر داده از پایگاه های داده غنی همچون Enrichr، STRING و Networkanalyst استفاده شد. در نهایت ژن های کاندید شده جدا و ارتباط پروتئینی آن ها نیز سنجیده شد.
نتایج: ۹۶۴ ژن با بیان بالا و ۸۳۷ ژن با بیان پایین در مسیرهای پیشرفت عفونت ویروسی های فرصت طلب با لنفوسیت ها نقش دارند. مسیر های چرخه سلولی، استرس اکسیداتیو، سنتز RNA و TGFB به صورت بارزی مشاهده شدند.
نتیجه گیری: مطالعه حاضر نشان داد که پروتئین ها و ژن های مهمی در تقویت التهاب ویروس های فرصت طلب همچون اپشتین بار و سایتومگالو ویروس نقش عمده ای داشته که از میان آن ها CDK۲, CCNB۱, GSK۳B, SRC و SMAD۳ نقش بارزتری را نشان دادند.
Keywords:
Epstein Barr Virus , Gene Expression Profile , Bioinformatics Analysis , Cytomegalovirus , Opportunistic Viruses , اپشتین بار ویروس , پروفایل بیان ژن , آنالیز بیوانفورماتیک , سایتو مگالو ویروس , ویروس های فرصت طلب
Authors
پریسا حسن زاده
MSc. in Biology, Department of Biology, Faculty of Basic Sciences, Islamic Azad University, Islamshahr Branch of Islamic Azad University, Islamshahr, Tehran, Iran
مهناز محمدی
Ph.D. in Biology, Assistant Professor, Department of Biology, Faculty of Basic Sciences, Islamic Azad University, Islamshahr Branch of Islamic Azad University, Islamshahr, Tehran, Iran
صبا طاهری
Ph.D. in Biology, Assistant Professor, Department of Biology, Faculty of Basic Sciences, Islamic Azad University, Islamshahr Branch of Islamic Azad University, Islamshahr, Tehran, Iran
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
