مطالعه برهم کنش های نانو موتورهای عملکردی و پروتئین پیش ساز آمیلوئید بتا به عنوان استراتژی نوین ضد آلزایمر توسط مدل سازی و شبیه سازی رایانه ای
Publish place: Journal of Health & Biomedical Informatics، Vol: 3، Issue: 2
Publish Year: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 13
This Paper With 18 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JHBMI-3-2_004
تاریخ نمایه سازی: 9 مرداد 1403
Abstract:
مقدمه: در این تحقیق عملکرد ۳ نانوموتور بر روی ۱۵ پپتید ترانس ممبرن پروتئین پیش ساز آمیلوئید بتا از طریق شبیه سازی دینامیک مولکولی انجام گرفت.
روش: در این مطالعه ۱۴ نوع موتانت و ۱ نوع نرمال پپتید ترانس ممبرن پروتئین پیش ساز آمیلوئید بتا از پایگاه داده NCBI به دست آمده و سپس شبیه سازی با استفاده از نرم افزارDesigner Ascalaph انجام شد. ۱۵ پپتید با ساختار های ۳ بعدی پایدار سنتز شده، برای ورود به مرحله شبیه سازی انتخاب و سپس با استفاده از نرم افزار HyperChem، به مدت ۳۰.۰۰۰ پیکو ثانیه پپتیدها در مجاورت نانوموتور های بیست الکله، هایپرسینی و رتینولی سنتز شده قرار داده شدند. سرانجام ۴ پارامتر؛ انرژی آزاد، انرژی بین مولکولی، پتانسیل و مجذور مربع اختلاف مقادیر، از نرم افزار استخراج و نسبت تغییرات آن ها محاسبه گردید.
نتایج: هر نانوموتوری نسبت به پپتیدهای متفاوت دارای عملکردی متفاوت است. نانوموتور هایپرسینی بر پپتید ۵، نانوموتور رتینولی بر پپتید ۱۰ و نانوموتور بیست الکل نیز تا حدودی بر روی پپتید ۴ بهترین عملکرد را داشتند. اما چون هر نانوموتوری تنها بر روی پپتید موتانتی خاص تاثیرگذار است و آلزایمر ناشی از موتاسیون های مختلف می باشد، نمی توان برای درمان آلزایمر تنها از یک نوع نانوموتور بهره برد.
نتیجه گیری: می توان نتیجه گرفت که در تحقیقات درمانی آلزایمر با در نظر گرفتن ساختار سه بعدی و پارامتر های دینامیکی، نانوموتور رتینولی بر روی پپتید موتانت ترانس ممبرن بسیار ایده آل بوده و می تواند راهکار درمانی مناسبی باشد.
Keywords:
Amyloid Precursor Protein , Alzheimer's disease , Simulation , Nanomotor , پروتئین پیش ساز آمیلوئید , آلزایمر , شبیه سازی , نانوموتور
Authors
سعیده جعفری نژاد
دانشجوی کارشناسی ارشد، مرکز تحقیقات زیست فناوری پزشکی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد اشکذر، یزد، ایران.
محمود دهقانی اشکذری
استادیار سلولی و تکوین، مرکز تحقیقات زیست فناوری پزشکی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد اشکذر، یزد، ایران.
علی جبالی
Ph.D. in Medical Nanotechnology Assistant Professor, Medical Biotechnology Research Center, Islamic Azad University-Ashkezar Branch, Ashkezar, Yazd, Iran.
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
