سیویلیکا را در شبکه های اجتماعی دنبال نمایید.

عدم تعادل پیوستگی Linkage Disequilibrium و اهمیت آن در طراحی نرم افزارهای بیو انفورماتیک در مباحث نوین ژنتیک

Publish Year: 1391
Type: Conference paper
Language: Persian
View: 11,342

متن کامل این Paper منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل Paper (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دانلود نمایند.

Export:

Link to this Paper:

Document National Code:

AGRIBIOTECH03_581

Index date: 18 July 2013

عدم تعادل پیوستگی Linkage Disequilibrium و اهمیت آن در طراحی نرم افزارهای بیو انفورماتیک در مباحث نوین ژنتیک abstract

در برخی موارد بین آلل های موجود در جایگاه های ژنی مختلف یک ارتباط پیش بینی نشده وجود دارد که با قوانین ژنتیک کلاسیک متفاوت است. این ارتباط غیر تصادفی بین آلل ها در جایگاه های ژنی مختلف را با عنوان عدم تعادل پیوستگی LD می شناسند و باعث می شود فراوانی های هاپلوتایپی مشاهده شده در جمعیت با فراوانی های مورد انتظار آن در قانون هاردی واینبرگ متفاوت باشد LD با توجه به فراوانی های هاپلوتایپی و آللی و با استفاده از آماره های مختلف اندازه گیری می شود LD به عنوان یک ابزار مهم مورد توجه است. امروزه استفاده از آماره های مختلف بیان کننده LD در مطالعات نوین ژنتیک همچون انتخاب ژنومیک ، نقشه یابی ژنومی و مطالعات GWAS به منظور پیشبرد مباحث بیوانفورماتیک و توسعه نرم افزارهای مختلف آن اجتناب ناپذیر است. مقاله حاضر سعی دارد تا با معرفی موارد استفاده از عدم تعادل پیوستگی در مباحث نوین ژنتیک، با انجام یک مطالعه موردی با استفاده از بسته نرم افزاری genetics در محیط R به تجزیه و تحلیل داده های حاصل از توالی یابی ژنی مربوط به چند مارکر ژنی پرداخته و نحوه برآورد آماره های مختلف عدم تعادل پیوستگی و نحوه تهیه جداول و نمودارهای مربوط به آن را ارائه نماید.

عدم تعادل پیوستگی Linkage Disequilibrium و اهمیت آن در طراحی نرم افزارهای بیو انفورماتیک در مباحث نوین ژنتیک Keywords:

عدم تعادل پیوستگی Linkage Disequilibrium و اهمیت آن در طراحی نرم افزارهای بیو انفورماتیک در مباحث نوین ژنتیک authors

مهدی خجسته کی

دانشجوی دکتری گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد

محمدرضا نصیری

دانشیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد

علی اصغر اسلمی نژاد

استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
Brancaa, a., Paapea, T.D., Zhoub, P., Briskinec, R., Farmerd, A.D., ...
Goldsteinand, D. B., Weale, M.E., 2001. Population genomics: Linkage disequilibrium ...
Hayes, B., 2003. Linkage disequilibrium mapping (LD) mapping and Bioinformatics ...
Hayes, B., 2007.QTL Mapping, MAS, and Genomic Selection. A short-course ...
Hayes, B., Visscher, P.M., McPartlan, H.C _ and Goddard, M.E., ...
Hao, K., Di, X., and Cawley, S.. 206. LdCompare: rapid ...
Huttley, G. _ Smith, M.W., Carrington, M and _ Brien, ...
Li, Na and Stephens, M. , 2003 .Modeling Linkage Disequilibrium ...
Warnes, G. R., 2010.Pairwise linkage disequilibrium between genetic markers. LD ...
نمایش کامل مراجع

مقاله فارسی "عدم تعادل پیوستگی Linkage Disequilibrium و اهمیت آن در طراحی نرم افزارهای بیو انفورماتیک در مباحث نوین ژنتیک" توسط مهدی خجسته کی، دانشجوی دکتری گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد؛ محمدرضا نصیری، دانشیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد؛ علی اصغر اسلمی نژاد، استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد نوشته شده و در سال 1391 پس از تایید کمیته علمی سومین همایش ملی بیوتکنولوژی کشاورزی ایران (گیاهی، دامی و صنعتی) پذیرفته شده است. کلمات کلیدی استفاده شده در این مقاله عدم تعادل پیوستگی، بیوانفورماتیک، جایگاه ژنی، نرم افزار R هستند. این مقاله در تاریخ 27 تیر 1392 توسط سیویلیکا نمایه سازی و منتشر شده است و تاکنون 11342 بار صفحه این مقاله مشاهده شده است. در چکیده این مقاله اشاره شده است که در برخی موارد بین آلل های موجود در جایگاه های ژنی مختلف یک ارتباط پیش بینی نشده وجود دارد که با قوانین ژنتیک کلاسیک متفاوت است. این ارتباط غیر تصادفی بین آلل ها در جایگاه های ژنی مختلف را با عنوان عدم تعادل پیوستگی LD می شناسند و باعث می شود فراوانی های هاپلوتایپی مشاهده شده در جمعیت با فراوانی ... . برای دانلود فایل کامل مقاله عدم تعادل پیوستگی Linkage Disequilibrium و اهمیت آن در طراحی نرم افزارهای بیو انفورماتیک در مباحث نوین ژنتیک با 3 صفحه به فرمت PDF، میتوانید از طریق بخش "دانلود فایل کامل" اقدام نمایید.