بررسی تنوع ژنتیکی اکوتیپ های آویشن شیرازی با استفاده از نشانگرهای مولکولیRAPD و ISSR

Publish Year: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 24

This Paper With 13 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJRFP-26-1_010

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1403

Abstract:

شناخت تنوع ژنتیکی از فعالیت­های مهم در به­نژادی و مدیریت حفظ ذخائر ژنتیکی گیاهان به‎شمار می آید. باتوجه به مشاهده گوناگونی صفات در بین آویشن شیرازی، در این تحقیق از نشانگر RAPD و  ISSRبه‎منظور بررسی تنوع ژنتیکی بین جمعیتی آویشن شیرازی در ایران استفاده شد. برگ­های آویشن از ۱۵ مناطق مختلف کشوری از استان­های کرمان، سیستان وبلوچستان­، بوشهر، فارس و خوزستان جمع­آوری شدند. استخراج DNA از برگ به­کمک روش CTAB با کمی تغییر انجام گردید. ­ده نشانگر  RAPDو­ ده نشانگر ISSR که باندهای واضح­تری در واکنش زنجیره­ای پلی­مراز تولید کرده بودند برای تجزیه وتحلیل استفاده شدند. با کمک نرم­افزاز NTSYS-pc با استفاده از ضر­یب تشابه دایس و الگوریتم میانگین فاصله (UPGMA) دندروگرام مربوطه رسم شد­. ضریب کوفنتیک محاسبه شد و پلات دوبعدی بر اساس تجزیه به مولفه­های اصلی شکل گرفت. باتوجه به نتایج حاصل، دامنه اندازه باندهای تولید شده در آغازگرها بین ۱۲۰ تا ۳۱۰۰ جفت باز متغیر بود­. پانزده ­منطقه انتخاب شده­ در ۳­ گروه مجزا قرار گرفتند .خوشه ایجاد شده با شرایط جغرافیایی همخوانی داشت. آغازگرها در مجموع ۲۰۷ نوار چند­شکل با درصد چندشکلی ۹/۸۶ تولید کردند. نتایج حاصل از ضریب تشابه دایس نرم­افزار ­NTYSIS حکایت از این مطلب داشت که تشابه ژنتیکی توده آویشن شیرازی بین۸۴۶۰/۰–۴۳۹۰/۰ متغیر است. کمترین تشابه بین توده­های جیرفت با ایرانشهر و بیشترین تشابه بین نمونه­های اندیمشک و ایذه مشاهده شد. نتایج تجزیه به مولفه­های اصلی و نتایج حاصل از تجزیه خوشه ای با یکدیگر مشابه بودند­ و ضریب کوفنتیک ۶/۷۴ درصد به­دست­ آمد. نتایج نشان داد که نشانگر­های­ RAPD وISSR  برای بررسی تنوع ژنتیکی بین جمعیتی این توده مناسب هستند.

Authors

H. Bibak

نویسنده مسئول مکاتبات، مربی بخش زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه جیرفت پست الکترونیک: Hbibak@ujiroft.ac.ir

K. Aghaabbasi

دانشجوی دکترای رشته بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه گیلان

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Ahmadi, M., Modarres Sanavy, A.M., Kafi, M., Sefidkon, F., Malekzadeh ...
  • Ahmadikhah, A., ۲۰۰۸. Advanced Genetics. Publication of Gorgan University of ...
  • Alamdary, B.L., Safarnejad, A. and Nematzadeh, G.A., ۲۰۱۲. Using RAPD ...
  • Cheghamirza, K., Koveza, OV., Konovalov, FA., Gostimskii, SA., ۲۰۰۴. Identification ...
  • Diederichen, A., Fu ,YB., ۲۰۰۶. Phenotypic and molecular (RAPD) differentiation ...
  • Echeverrigaray, S., Agostini, G., Atti-Serfini, L., Paroul ,N., Pauletti, GF,. ...
  • Eftekhar, F., Zamani, S., Yusefzadi, M,. Hadian, J. and Nejad ...
  • Farsani, T., Etemadi, N. and Seid Tabatabaie, B., ۲۰۰۸. Analysis ...
  • Ghasemi, N., ۲۰۰۴. Iranian herbal pharmacopeia ministry of hygiene ۱st ...
  • Ghouth, K., Malekzadeh, S., Rashedmohsel, M.H., Akbari M.R and Razavi, ...
  • Hamrick, J.L. and Godt, M.J.W., ۱۹۸۹. Allozymes diversity in plant ...
  • Ismaeili, A., Zabetti, M., Madah Areffie., Nazarian Firooz Abadi, F. ...
  • Judy, M.H., Mahdavi, M., ۲۰۱۱. Identification applications of pastures, Aizh, ...
  • Justus M., Ester, M., Kahangi, W. and Fusao, M., ۲۰۰۴. ...
  • Kafkas,S., Ozkan ,H., Erol , B ., Acer, I ., ...
  • Karimi­shahri, M.R., Dehvary, V., Hajianshahri, M. and Mokhtareyan, H., ۲۰۱۲. ...
  • Khansari Nejad, B., Hasandokht M.R., Nazeri, V. and Sorny, A., ...
  • Landry, B. S., Kessel, I R.V., Farrara, B. and Michelmore, ...
  • Lopez-Pujol J,Bosch M., Simon, J. and Blanche, C., ۲۰۰۴. Allozyme ...
  • MirzaeiNodoushan, H., Mehrpour, S. and Sefidkon, F., ۲۰۰۷. Path analysis ...
  • Nematzadeh, G. A. and Kiani, G.H., ۲۰۰۴. Plant breeding. Mazandaran ...
  • Sarkhosh, A. Zamani, Z. Fatahi R. and Ebadi, A., ۲۰۰۶. ...
  • Sefidkon, F. and Rahimi Bidgoli, A., ۲۰۰۳. Quantitative and qualitative ...
  • Seid Tabatabaie, B., Rahim­Malek, M., Talebi, M., Yamchi, A., Etemadi, ...
  • Shashidhara, G., ۲۰۰۲. Genetic evaluation of elite sandle wood (Santalum ...
  • Sicard, D., Nanni, L., Porfiri, O., Bulfon, D. and Papa, ...
  • Souframanien, J. and Gopalkrisha, T.,۲۰۰۴. A comparative analysis of Genetic ...
  • Sunar, S., Aksakal, O., Yildirim, N., Agar, G., Gullunce, M. ...
  • Tae-jin, T., Sum, J. Y., Jang, W. and Bae kim, ...
  • Ven Katachalam, L., Sreedhar, R V., Bhagyalakshmi, N,. ۲۰۰۸. The ...
  • Wanntorp, LA., Kocyan, R., van, D. and Renner, S., ۲۰۰۶. ...
  • Williams, J.G.K., Kubelik, A.R., Livak, K.J., Rafalskiand, J.A. and Tingey, ...
  • Zamani, Z., Sarkhosh , M. and Fatahimoghadam, H., ۲۰۰۷. Assessment ...
  • نمایش کامل مراجع