تفکیک سویه های سیائوباکتری دارای هتروسیست از سویه های فاقد هتروسیست در بررسی فیلوژنتیکی با استفاده از تکنیک PCR از ناحیه ژنی 16S Rrna
Publish place: 12th Congress of Iranian Genetics Society
Publish Year: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 835
This Paper With 6 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS12_0559
تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392
Abstract:
شناسایی مولکولی و مطالعه فیلوژنتیکی سویه های سیانوباکتریها در سالهای اخیر موضوع مورد توجه در میان جلبک شناسان بوده و تحقیقات زیادی در این زمینه صورت گرفته است. وجود سلول های یژه ای به نام هتروسیست در برخی سویه های سیانوباکتری که به آنها توانایی تثبیت ازت را در شرایط هوازی می دهد و حاوی آنزیم نیتروژناز می باشند، می تواند به عنوان ویژگی مناسبی در خصوص مطالعات فیلوژنتیکی باشد. بههمین جهت به شناسایی مولکولی و مطالعه فیلوژنتیکی یازده سویه سیانوباکتری با استفاده از تکنیک PCR از ناحیه ژنی 16s Rrna پرداخته شد. در مطالعه ژنتیکی این سویه ها، نتایج حاصل از شناسظایی مولکولی بر اساس توالی یابی ناحیه ژنی 16s rRNA مؤید صحت شناسایی مورفولوژیک بود و توالی سویه های شناسایی شده در پایگاه اطلاعاتی NCBI ثبت گردیدند. در بررسی های فیلوژنتیکی حاصل از روش توالی یابی از ناحیه ژنی 16s Rrna مشخص شد که در درخت فیلوژنتیکی با استفاده از الگوریتم Neighbor-Joining سویه های هتروسیست دار از سویه های فاقد هتروسیست جدا شدند ولی سویه های بر اساس موقعیت هتروسیست تفکیک نشدند. به عبارت دیگر در درخت فیلوژنتیکی حاصل، موقعیت هتروسیست در گروه بندی سویه های هیچ دخالتی نداشته است. همچنین ارزیابی درخت فیلوژنتیکی حاصل مقادریر Bootstrap بسیار بالا را نشان داد که مژید نژدیک بودن درخت فیلوژنتیکی ترسیم شده به درخت فیلوژنتیکی واقعی می باشد.
Keywords:
Authors
فرزانه زندی
دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه بین المللی امام خمینی، قزوین
رامین حسینی
استادیار، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه بین المللی امام خمینی، قزوین
ندا سلطانی
دانشیار، گروه میکروبیولوژی، پژوهشکده علوم پایه کاربردی جهاد دانشگاهی، تهران
رحیم حداد
استادیار، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه بین المللی امام خمینی، قزوین
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :