طراحی مدل های پیش بینی جهت تعیین ساختار ارگانیزمی آنزیم استریول کوآنزیم آ دی سچوراز

آنزیم استریول کوآنزیم آ، آنزیمی دی سچوراز یا غیر اشباع کننده است که باعث اضافه شدن اولین پیوند دوگانه به زنجیره اسید چرب 18 کربنه ی امگا 3 و یا امگا 6 می شود. اسیدهای چرب امگا 3 باعث افزایش زمان خونریزی می شوند که به علت کاهش تجمع پلاکت ها، افزایش سیالیت خون و فیبروژن ها و افزایش شکل پذیری و انعطاف گلبول های قرمز ایجاد می شود، در نهایت امگا 3 باعث کاهش انعقاد خون می شود. هدف: پیدا کردن مهمترین مؤلفه های ژنی اختصاصی ارگانیزمی آنزیم (SCD) Stearyol Co-A Desaturase با استفاده از ابزارهای بیو انفورماتیکی و طراحی مدلهای پیش بینی جهت تعیین ا رگانیزمهای این آنزیم ها می باشد. روش: با استفاده از ابزارهای مدلسازی و برنامه های مختلف داده کاوی نسبت به طراحی بانک اطلاعاتی از متغیرهای ژنی حدود 763 فستای ژنی آنزیمهای فوق در گونه های مختلف اقدام شده و سپس با استفاده از مدلهای وزن دهی، درخت های تصمیم گیری و روشهای دسته بندی نسبت به شناسایی مهمترین متغیرها اقدام شد. در نهایت برای اولین بار طراحی مدل های پیش بینی نوع ارگانیزم براساس متغیرهای ژنی انجام شد. نتیجه: مهمترین متغیر ژنی در تشخیص ساختارهای ارگانیزمی آنزیم SCD، مولفه ی طول رشته ی نوکلئوتیدی بوده است. همچنین مدلهای پیش بینی طراحی شده نشان دادند که مدل شبکه ی عصبی (Neural Net) با دقت 89.26% می تواند ارگانیزم آنزیمهای جدید را براساس خصوصیات ژنی پیش بینی نماید.

Keywords:

, Stearyol Co-A Desaturase , استریول کوآنزیم آ دی سچوراز , SCD و امگا 3