ژنوتاپینگ سویه های هلیکو باکترپیلوری جدا شده از نمونه های بیوپسی در شهرستان شهرکرد به روش RAPD PCR

هلیکوباکتر پیلوری از عوامل مهم بیماری های گوارشی می باشد. از آن جا که تنوع ژنتیکی درون جمعیت هلیکوباکتر پیلوری به میزان زیاد رخ می دهد، با روش هایی مانند RAPD-PCR رابطه ی احتمالی بین ژنوتیپ های ویژه ی هلیکوباکتر پیلوری و بیماری های مختلف معده را تعیین کرد. در این تحقیق الگوی ژنتیکی سویه های هلیکوباکتر پیلوری جدا شده از بیماران مختلف دچار سو هاضمه با روش RAPD-PCR بررسی شدند. طی این مطالعه نمونه های بیوبسی ۴۰ بیمار شامل ۲۰ بیمار طبیعی، ۱۶ بیمار دچار زخم و ۴ بیمار دچار سرطان، با استفاده از کیت استخراج DNA ساخت شرکت سیناژن، استخراج DNA آن ها صورت گرفت و در حضور پرایمر ۱۶srRNA تشخیص قطعی سویه ها انجام شد و ژنوتایپینگ سویه ها به روش RAPD-PCR صورت گرفت. در این تحقیق پس از انجام آزمون PCR به منظور تشخیص قطعی هلیکوباکتر پیلوری تمامی نمونه ها با داشتن باند ۱۰۹ جفت بازی مثبت تشخیص داده شدند. در دندروگرام به دست آمده در آزمون RAPD-PCR در ۴۰ سویه هلیکوباکتر پیلوری مورد بررسی در نمونه های بیوپسی به طور کلی قرابتی بین ۵۴ تا ۹۸ درصد در میان جدایه ها مشهود است. تمامی جدایه ها در ۹ خوشه اصلی از یکدیگر متمایز شدند. در ضریب تشابه ۸۰ درصد مجموعا ۳۰ پروفایل شامل ۹ خوشه و ۲۱ نقطه جداگانه شناسایی شد. در بررسی قطعات DNA الکتروفورتیک اشکال زیر مشاهده گردید که نتایج به دست آمده از نظر ژنتیکی متنوع و ناهمگن است. نتایج به دست آمده بر روی ۲۰ سویه جدا شده از بیماران طبیعی نشان داد که هر یک از سویه ها الگوی انگشت نگاری ژنتیکی مخصوص به خود را دارند.

Keywords:

بیوپسی , ژنوتایپینگ , هلیکوباکتر پیلوری , RAPD-PCR