بررسی عملکرد مولکولی بیان ژنی در ارتباط با عفونت های ویروسی سین سیشیال تنفسی

مقدمه: مطالعات نشان داده است که تا ۶۸ درصد از نوزادان ممکن است در سال اول زندگی خود به ویروس سین سیشیال تنفسی (RSV) مبتلا شوند و تقریبا همه کودکان تا دوسالگی مبتلا می شوند. در این مطالعه با استفاده از آنالیز بیوانفورماتیک به بررسی و کاندید نمودن ژن های موجود در مسیرهای وابسته به عفونت ویروس سین سیشیال تنفسی (RSV) پرداخته شد. مواد و روش­ ها: با مراجعه به پایگاه داده GEO مجموعه داده ها (دیتاست) مناسب برای آنالیز انتخاب گردید. این دیتاست شامل پروفایل بیان ژنی در عفونت ویروس سین سیشیال تنفسی (RSV) بود. کلاسترهای ژنی با بیان بالا و پایین دسته بندی شدند. برای ارزیابی دقیق تر داده از پایگاه های داده غنی همچون Enrichr، STRING و Panther استفاده شد. در نهایت ژن های کاندید شده جدا و ارتباط پروتئینی آن ها نیز سنجیده شد. یافته ­ها: ۷۴۰ ژن، افزایش بیان و ۸۲۲ ژن، کاهش بیان داشتند. که این ژن ها می توانند در مسیرهای عفونت ویروس سین سیشیال تنفسی در کودکان نقش داشته باشند. مسیرهای NOD like receptor، اپشتین بار- آنفلوآنزا، توبرکلوزیس، لیشمانیازیس، نکروپتوزیس و سالمونلا بیان بالا داشته و مسیرهای کرونا ویروس، هرپس ویروس، نقص سیستم ایمنی، گیرنده سلول های لنفوسیت ۱Th، ریبوزوم، NFKappa B و ۱PDL در نقاط وارسی چرخه سلولی  بیان پایین داشتند. بحث و نتیجه­ گیری: مطالعه حاضر نشان داد، که پروتئین ها و ژن های مهم در تقویت التهاب ویروس سین سیشیال تنفسی در کودکان نقش عمده ای دارد. که از میان آن ها " ۳ STAT، ۴ TLR A۲۶,RPL۱STAT و ۴ MAPK" نقش بارزتری را در این مسیر نشان دادند.

Keywords:

Bioinformatic analysis , Gene expression profile , Nasopharyngeal cells , Respiratory syncytial virus (RSV) , ویروس سین سیشیال تنفسی , پروفایل بیان ژن , آنالیز بیوانفورماتیک , سلول های نازوفارنژ