مولکولی rpL32-trnLUAG spacer

جنس Tanacetum L. متعلق به زیرتبار Anthemidinae، تبار Anthemideae از تیره Asteraceae است. این جنس با داشتن 160 گونه، سومین جنسبزرگ تبار Anthemideae میباشد و از موقعیت ویژهای برای درک فیلوژنی تبار و ردهبندی زیرتبار برخوردار است. این جنس با تعداد قابل توجه گونههایانحصاری در ایران، جزئی از تنوع زیستی و ذخایر ژنتیکی کشور است که گونههای مختلف آن از اهمیت دارویی و زینتی برخوردارند. در بازساز یهایفیلوژنتیکی با استفاده از دادههای ژنوم هستهای nrDNA ITS و کلروپلاستیOberprieler et al. 2007; Sonboli et al. 2012) ،cpDNA trnH-psbA ) توالیهای بکار رفته بین نمایندگان Tanacetum در مقایسه با تنوع بالای ریختشناسی جنس واگرایی بسیار پایینی نشان دادند بطوریکه روابط فیلوژنیداخل جنس همچنان حل نشده باقی ماند. اخیراً نشانگرهای مولکولی DNA کلروپلاستی با سرعتهای تکاملی و تغییرپذیری بسیار بالا برای پاسخگویی بهسؤالات فیلوژنتیکی در سطوح پایین (درون گونهها- بین جمعیتها، و بین گونهها) معرفی شده اند (Shaw et al. 2005, 2007؛Naumann et al. 2011 ؛ Miller et al. 2009؛ 07Timme et al. 20) که از بین آنها میتوان به rpL32-trnLUAG spacer اشاره کرد. این نشانگر در ناحیه تکنسخ های کوچک(cpDNA (Small Single Copy/SSC قرار دارد. در مطالعه حاضر نشانگر rpL32-trnLUAG spacer برای بازسازی روابط فیلوژنی تعدادی از گونه هایTanacetum با استفاده از روشهای آنالیز مختلف شامل Neighbor-joining (NJ) ،Maximum parsimony (MP) و همچنین روشهایmodel-based نظیر Bayesian بکار گرفته شد. طول همردیف سازی شده rpL32-trnLUAG spacer در گونه های مطالعه شده bp 1256 است که از این تعداد،bp 194، Parsimony informative هستند. درصد نوکلئوتیدهای A ،C ،T و G در این قطعه به ترتیب 2/37%، 3/11%، 8/38% و/8 12% میباش د. آنالیزMP این دادهها منجر به یک درخت به طول 528 گام تکاملی و با شاخص سازگاری (Consistency Index/CI) و نگهداری (Retention Index/RI) به ترتیب4/0 و 56/0 شد .این توالی از واگرایی و قدرت تفکیک بالایی در بین گونه های مورد مطالعه Tanacetum برخوردار است و روابط بین این گونهها را ب هخوبیحل میکند و شاخه ها از حمایتهای آماری بالایی برخوردارند.

Keywords:

توالی کلروپلاستی , فیلوژنی مولکولی , Tanacetum , rpL32-trnLUAG spacer