مطالعه پریون انسانی ونوع موتاسیون یافته آن Asp178Asn به روش شبیه سازی دینامیک مولکولی

روش شبیه سازی دینامیک مولکولی به منظور بررسی جزئیات ساختاری برای دو گونه پریون انسانی و نوع موتاسیون یافته آن بکار گرفته ش د. نتایج نشانمیدهد در گونه موتاسیون یافته ، انعطاف پذیری بالا میرود که ما آنرا به دنباله های خاص که در معرض حلال قرار مگیرند مرتبط میدانیم که میتوانندلنگرگاه مناسب برای تماسهای اولیه بین مولکولی بحساب بیایند. متوسط انرژی کل بر طبق برنامه گرومکس برای پریون انسانی نسبت به نوع موتاسیون یافتهدر سطح انرژی پائین تری قرار گرفته است. نتایج نشان میدهد که نوع موتاسیون یافته مستعد تغییرات کانفورماسیونی میباشد. افزایش سطح قابل دسترسحلال در دنباله های آرژنین136 وگلوتامیک196منجر به تضعیف برخی از پیوندهای هیدروژنی مهم در پریون موتاسیون یافته شده است. مطالعه تغییراتفاصله نشان میدهد که زنجیره های جانبی در پل نمکی Glu146–Arg208 and Arg156–Glu196 به میزان قابل ملاحظه ای بهم نزدیک میشوند. اینتغییرات ساختاری می توانند شرایط را برای رسیدن به ساختارهای معیوب هموار سازند. ساختمان دوم نیز نشان میدهد تغییرات ساختاری در دنباله هایخاص متمرکز میباشند. این تغییرات ساختاری تحت نیروهای گلوبال کنترل میشوند. دستاوردهای حاضر ممکن است در طراحی دارو به منظور درمان یاپیشگیری مفید باشند.

Keywords:

شبیه سازی دینامیک مولکولی , پریون انسانی , سطح قابل دسترس حلال , پایداری ساختاری , پل نمکی