الگوریتم سریع مرزبندی دنباله ها در بیوانفورماتیک با استفاده از بلوم فیلتر

Publish Year: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 669

متن کامل این Paper منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل Paper (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

RAZICONF01_172

تاریخ نمایه سازی: 14 شهریور 1393

Abstract:

دراین مقاله الگوریتمی برای مرزبندی دنباله ها در بیوانفورماتیک با استفاده از بلوم فیلتر ارائه میشود. ایده بکار گرفته شده در این پژوهش یافتن زیررشته های همسان در دو دنباله و مرزبندی با استفاده از این زیررشته ها میباشد. برای تعیین زیررشته های همسان از بلوم فیلتر که عملیات مقایسه را سرعت میبخشد استفاده میشود. هدف از ارائه این الگوریتم سرعت بخشیدن به انجام عملیات مرزبندی دنباله ورودی با شبیه ترین دنباله ی پایگاه داده، در مقایسه باروشهای گذشته میباشد. با استفاده از این الگوریتم پیچیدگی زمانی از O(m^2 در روش برنامه سازی پویا به O(m برای مقایسه دو دنباله، که m طول دنباله میباشد، کاهش یافته است

Authors

حسین یوسفی

دانشجوی کارشناسی رشته کامپیوتر دانشکده فنی و مهندسی دانشگاه رازی

محمود احمدی

استادیار گروه کامپیوتر دانشگاه رازی

حمیدرضا روشنی

دانشجوی کارشناسی رشته کامپیوتر دانشکده فنی . مهندسی دانشگاه رازی

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • IsaevA., 2 0 06Introduction to mathematical method in bioinformatics, Australian ...
  • JainN., DahlinM., TewariR., 2005sing Bloom Filters to Refine Web Search ...
  • Broder, A., et al. 2002 Network Applications ofBloom Filters: A ...
  • نمایش کامل مراجع