برای مسئله استنباط هاپلوتایپ با دیدگاه صرفهجویی freeCollhaps الگوریتم هیوریستیک کامل
Publish place: 7th national biotechnology congress of I.R. iran
Publish Year: 1390
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 491
This Paper With 6 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI07_0930
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
Abstract:
هاپلوتایپ مجموعهای از چندشکلیهای تک نوکلئوتیدی (اسنیپها)، و اسنیپ از معمولترین تغییرات ساختاری میباشد. با توجه به این که برخی از بیماری های ژنتیکی ناشی از تغییرات در ساختار ژنوم است، بررسی هاپلوتایپ مورد توجهبسیاری از محققین قرار گرفته است. اما بدلیل محدودیتهایی که در بدست آوردن هاپلوتایپها وجود دارد، از دادههای ژنوتایپ استفاده میشود. لذا بدست آوردن یک مجموعه هاپلوتایپ از روی ژنوتایپها را استنباط هاپلوتایپ میگویند. اگر بدنبال یافتنسخت می - NP کمترین تعداد هاپلوتایپ باشیم شرایط صرفهجویی کامل را فراهم آوردهایم، که اثبات شده است این یک مسئله freeCollhaps می باشد. الگوریتم Collhaps باشد. در حال حاضر سریعترین الگوریتم هیوریستیک برای این مسئله، الگوریتم بوده با این تفاوت که معیار فاصله هاپلوتایپها بهبود داده شده است. نتایج حاصل از آزمایشهای صورت Collhaps مشابه الگوریتم گرفته نشان میدهد که این روش کارایی نسبتا مناسبی دارد.
Keywords:
Authors
سمیرا رمضانی
گروه مهندسی کامپیوتر و فناوری اطلاعات، دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان، ایران
سید رسول موسوی
۲ گروه مهندسی کامپیوتر و فناوری اطلاعات، دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان، ایران
مجید طالبی
گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :