آلودگی به عنوان جدی ترین تهدید تروریستی برای سامانه های تامین آب شناخته می شود. دو جنبه مهم
امنیت سامانه توزیع، نظارت و کنترل از راه دور برای تشخیص حضور آلاینده ها و استفاده از مدل های کیفیت آب/هیدرولیک برای ردیابی آلاینده ها پس از ورود به سامانه می باشد. انواع
تهدیدات شامل 4 دسته
تهدیدات سایبری،
تهدیدات فیزیکی،
تهدیدات شیمیایی و
تهدیدات بیولوژیکی می باشد. سامانه اسکادا توانایی کنترل از راه دور تجهیزات موجود در ایستگاه ها و پایش مداوم کیفیت آب در سامانه تصفیه و توزیع را دارد. از کاربردهای مهم سامانه های مدیریت هشدار و سامانه های ثبت هشدار که به عنوان زیر مجموعه شبکه های اسکادا می باشد، کنترل و مانیتورینگ ایستگاه های پمپاژ آب و تصفیه خانه ها می باشد. اپراتورها با استفاده از مدل های هیدرولیکی و کیفیت آب می توانند برای تغییر تنظیمات عملیاتی استفاده کنند یا در صورت وقوع آلودگی، واکنش انجام دهند. هدف از ارزیابی آسیب پذیری، ایجاد لیستی از اولویت های خاص سامانه با هدف کاهش خطرات
تهدیدات حمله است. از مهمترین حفاظت ها در برابر حمله به یک سامانه توزیع، مانده ماده ضدعفونی کننده در سامانه است. استفاده از کلر در آب آشامیدنی و نیز استفاده از سامانه های اسمز معکوس، باعث از بین رفتن میکروارگانیسم های بیماری زا و خطرناک در آب می شود