استفاده از توالی های رونوشت عقرب جهت مطالعه شبکه ژنی موثر بر سرطان

کشف تکنیک توالی یابی نسل جدید (NGS) موجب شناسایی ژن های درگیر در سیستمهای بیولوژی مختلف گردید. این فناوری ابزار قدرتمندی در جهت تجزیه و تحلیل رونوشت های سلولی، در بسیاری از زمینه های تحقیقاتی میباشد و استفاده از داده های حاصل از این فناوری، تجزیه و تحلیل شبکه های زیستی را ممکن می سازد. از آنالیز شبکه ها میتوان جهت شناسایی ژنهای دخیل در چرخه های سلولی و بیماریزایی، به عنوان نشانگر های مولکولی، برای شناسایی، تشخیص و تخمین اهداف بیولوژیکی بهره برد. در این پژوهش از عقرب به عنوان مدل جهت بررسی شبکه برهمکنش میان پروتئینهای درگیر در سرطان استفاده شده است. پس از آنالیز ویژگی های توپولوژیکی شبکه ژنی داده های ترانسکریپتوم عقرب توسط نرم افزار cytoscape، مشخص شد که از مجموع 195 ژن درگیر در سرطان، 34 ژن دارای بیشترین درجه اثر متقابل با دیگر ژنها هستند و این ژنها محل تجمع سیگنالها به حساب میآیند که میتوان آن ها را به عنوان نشانگر ملکولی سرطان معرفی کرد. این نشانگرها در مسیرهای زیستی نظیر چرخه سلولی، تکثیر و تمایز، آپوپتوزیس و غیره نقش دارند..

Keywords:

عقرب , توالی یابی نسل جدید , سیستمهای بیولوژی , نشانگرهای مولکولی , سرطان