خط شناسه گذاری DNA گونه های Aspergillus جدا شده از غلات در شمال غرب ایران
صاحب اثر: سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
نوع محتوی: طرح پژوهشی
Language: Persian
استان موضوع گزارش: تهران
شهر موضوع گزارش: تهران
Document ID: R-1054749
Publish: 16 February 2019
دسته بندی علمی: علوم کشاورزی
View: 283
Pages: 174
Publish Year: 1393
نسخه کامل Research منتشر نشده است و در دسترس نیست.
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
Abstract:
خط شناسه گذاری DNA که یک حوضه علمی کاملا جدید در زمینه مطالعات تاکسونومی، سیستماتیک و تنوع زیستی موجودات مختلف می باشد، دارای اهمیت معنی داری در طبقه بندی سریع، دقیق و مطمین گونه های متنوع موجودات زنده و مهم از نظر اقتصادی، پزشکی و کشاورزی می باشد. جنس آسپرژیلوس که یکی از بزرگ ترین جنس های قارچی می باشد، بدلیل اهمیت اقتصادی و پزشکی قابل ملاحظه و پیچیدگی های ژنومی، یکی از جنس های قارچی مناسب جهت مطالعات خط شناسه گذاری DNA می باشد. تحقیق حاضر با هدف مشارکت در تحقیقات جهانی خط شناسه گذاری DNA قارچ ها و راه اندازی این تحقیقات در ایران جهت شناسایی ارگانیسم های مهم صنعتی، کشاورزی و پزشکی در اکوسیستم های مختلف اجرا شد. در این تحقیق تعداد 564 جدایه آسپرژیلوس، اغلب جداسازی شده از اندام های هوایی غلات، مورد مطالعه قرار گرفت. تعداد 100 نمونه DNA با استفاده از روش PCR-RFLP روی فراورده های تکثیر یافته ژن -tubulin انتخاب شده و در مناطق ژنی ITS nrDNA، -tubulin و calmodulin توالی یابی شدند. به طور همزمان مطالعات ریخت شناسی این جدایه ها پس از کشت دادن آن ها روی محیط کشت های استاندارد این قارچ و اعمال شرایط انکوباسیون مناسب انجام گرفت. بر اساس انطباق نتایج آنالیزهای مبتنی بر توالی و مطالعات ریخت شناسی تعداد 41 گونه آسپرژیلوس شناسایی شد که از این میان 18 گونه برای فلور قارچ های ایران و 10 گونه برای جهان جدید می باشند. اگر چه منطقه ITS nrDNA در حال حاضر به عنوان خط شناسه DNA رسمی برای اغلب گروه های قارچی پذیرفته شده است، نتایج این تحقیق عدم کارایی آن در شناسایی موفق اغلب گونه های آسپرژیلوس را اثبات کرد. معرفی ژن calmodulin به عنوان خط شناسه DNA گونه های آسپرژیلوس مستلزم طراحی آغازگرهای مناسب جهت تکثیر آسان و پایدار آن در اغلب گروه های آسپرژیلوس می باشد. با در نظر گرفتن مزیات عمده ژن -tubulin از قبیل تکثیر آسان، توانایی تمایز موفق اغلب گونه های آسپرژیلوس و ارایه اطلاعات تاکسونومیکی مفید، این ژن به عنوان مارکر خط شناسه DNA مناسب برای جنس آسپرژیلوس پیشنهاد می شود. کلمات کلیدی: آسپرژیلاسه، آنالیزهای فیلوژنتیکی، توالی یابی DNA، کشف گونه