ایجاد جمعیت پایه ژنتیکی قزل آلای رنگین کمان بر اساس مطالعه تنوع ژنتیکی مولدین این ماهی با استفاده از ریزماهوارک ها
صاحب اثر: سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
نوع محتوی: طرح پژوهشی
Language: Persian
استان موضوع گزارش: تهران
شهر موضوع گزارش: تهران
Document ID: R-1056154
Publish: 16 February 2019
دسته بندی علمی: علوم کشاورزی
View: 222
Pages: 87
Publish Year: 1392
نسخه کامل Research منتشر نشده است و در دسترس نیست.
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
Abstract:
به منظور اجرای پروژه، تعداد 446 نمونه از ماهی قزل الا از 24 مزرعه از استانهای مختلف کشور جمع آوری گردید. از هر نمونه 2 تا 3 گرم از باله دمی بریده و پس از تثبیت در الکل اتانول مطلق به آزمایشگاه منتقل گردید. DNA ژنومی نمونه ها از بافت نرم باله ماهی به روش فنل- کلروفرم استخراج و سپس کمیت و کیفیت DNA استخراج شده با استفاده از اسپکتروفتومتر و الکتروفورز ژل آگارز 1 درصد تعیین شد. واکنش PCR با استفاده از 10 جفت پرایمر ریزماهواره صورت گرفت. محصول PCR با استفاده از ژل پلی آکریل آمید 6 درصد الکتروفورز و با نیترات نقره رنگ آمیزی شد. جهت سنجش وزن مولکولی محصول PCR بر حسب جفت باز (bp) و تعیین ژنوتیپ ها از نرم افزار UV Duc استفاده گردید. مقادیر مربوط به فراوانی آللی، تعداد آللهای واقعی و موثر، هتروزیگوسیتی مشاهده شده و مورد انتظار، شاخص شانون، میزان شباهت و فاصله ژنتیکی، تعادل هاردی- واینبرگ، مقادیر FST ، RST و جریان ژنی بر اساس تست AMOVA با استفاده از نرم افزار ژنتیکی Gene Alex و Popgene محاسبه گردید. نتایج بدست آمده از این بررسی نشان می دهد که 8 جفت پرایمر میکروستلایتی بررسی شده، پلی مورف بودند. در مجموع تعداد 50 الل شناسایی گردید که محدوده اندازه آنها بین 64-280 جفت باز بوده است. جایگاه Omyf با 26 آلل دارای بیشترین آلل و جایگاه 474 OTSG و Strurruta58 با 5 آلل دارای کمترین تعداد آلل بود. همچنین هتروزیگوسیتی مشاهده شده (Ho) بین مزرعه نمونه برداری در جایگاههای ده گانه بین 0/825 تا 0/964 در بررسی تعادل هاردی- واینبرگ مزارع ،18،15،20 4E و 21 در تمامی لوکوس ها ی مورد بررسی انحراف از تعادل هاردی واینبرگ را نشان داده و خارج از تعادل بودند (05.0> P) . در این بررسی، مزارع ،14،8،7،6 در 3 جایگاه در تعادل هاردی واینبرگ بودند و در بقیه جایگاهها خارج از تعادل بودند. سایر مزارع در یک یا دو جایگاه در تعادل بوده و در 8 یا 9 جایگاه خارج از تعادل بودند. نتایج بدست آمده از FST نشان می دهد که حداکثر آن (0/24) بین نمونه های مزرعه 1و11 که دارای کمترین میزان جریان ژنی (3/7) است مشاهده می شود. حداقل 04/0) FST) بین نمونه های مزرعه 8 و9 که دارای بیشترین میزان جریان ژنی (346) است مشاهده می شود. براساس نتایج حاصل از تست AMOVA بین تمام مزارع با یکدیگر اختلاف معنی دار مشاهده می شود (01.0> P) . علاوه بر این بر اساس معیار 1972) Nei) بیشترین فاصله ژنتیکی (0/89) بین نمونه های مزرعه 2 با 11 و کمترین شباهت ژنتیکی (0/15) میان نمونه های مزارع 3 با 4 وجود دارد. با توجه به داده های حاصله بررسی حاضر تنوع ژنتیکی بدست آمده در مزارع پرورشی ماهی قزل الا در کشور قابل توجه بوده و می تواند به عنوان مطالعه پایه در ایجاد جمعیت پایه در برنامه های اصلاح نژادی کمک نماید.