سیویلیکا را در شبکه های اجتماعی دنبال نمایید.

تجزیه و تحلیل توالی ناحیه اینترون 5 ژن PIT-1 در مرغان گوشتی لاین آرین

Publish Year: 1393
Type: Journal paper
Language: English
View: 330

This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download

Export:

Link to this Paper:

Document National Code:

JR_JOAGK-6-3_006

Index date: 5 December 2020

تجزیه و تحلیل توالی ناحیه اینترون 5 ژن PIT-1 در مرغان گوشتی لاین آرین abstract

توالی یابی و تجزیه و تحلیل اطلاعات بدست آمده یکی از بهترین و رایج ترین روش­ها در مطالعات تنوع ژنتیکی می باشد. ژن PIT-1 به نام فاکتور 1 ژن هورمون رشد معروف است. این ژن عضوی از خانواده فاکتورهای نسخه برداری است و در طیور روی کروموزوم 1 با طول تقریباً kb14 قرار دارد و دارای 7 اگزون و 5 اینترون می باشد. هدف از انجام این پژوهش تجزیه و تحلیل توالی ناحیه اینترون 5 ژن PIT-1 در مرغان گوشتی لاین آرین و ترسیم درخت فیلوژنی آن با سایر نژادهای مرغ بود. برای انجام این پژوهش از 7 قطعه مرغ از هر دو جنس مرغان گوشتی لاین آرین نمونه خون جمع آوری شد . پس از استخراج DNA، ژن مورد نظر توسط آغازگرهای اختصاصی تکثیر و قطعات تکثیر شده پس از خالص سازی به صورت رفت و برگشت توالی یابی شدند. تعداد 5 هاپلوتیپ مختلف بر اساس 6 نوکلئوتید چند شکل موجود در توالی ها تعیین گردید و توالی های نهایی بدست آمده از هر هاپلوتیپ با طول تقریبی260 جفت باز که شامل 92/21 درصد آدنین، 08/18 درصد گوانین، 69/32 درصد سیتوزین،31/27 درصد تیمین بود. پس از اطمینان از صحت توالی یابی در پایگاه اطلاعاتی بانک ژن با شماره های دسترسیJQ946630- JQ946636  ثبت شدند. پس از اخذ توالی های مشابه ژن PIT-1دیگر نژادهای موجود در بانک جهانی ژن درخت فیلوژنی با استفاده از آنها ترسیم شد. نتایج فیلوژنی مشخص کرد که مرغ آرین ایران با مرغان آمریکایی در یک گروه قرار دارند.

تجزیه و تحلیل توالی ناحیه اینترون 5 ژن PIT-1 در مرغان گوشتی لاین آرین Keywords:

تجزیه و تحلیل توالی ناحیه اینترون 5 ژن PIT-1 در مرغان گوشتی لاین آرین authors

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
Excoffier L, Laval G, Schneider S (2005). Arlequin version 3.0: ...
Groenen MA, Cheng HH, Bumstead N, Benkel BF, Briles WE, ...
Hall TA (1999). BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor ...
Hiendleder S, Kaupe B, Janke A (2002). Molecular analysis of ...
Javanrouh A, Banabazi M.H, Esmaeilkhanian S, Amirinia C, Seyedabadi H.R, ...
Li WH, Wu CI, Luo CC (1984). Nonrandomness of point ...
Nei M, Kumar S (2000). Molecular Evolution and Phylogenetics. Oxford ...
Nie Q, Fang M, Xi L, Zhou M, zhang X ...
Parmentier I, Portelle D, Gengler N, Prandi A, Bertozzi C, ...
Pirani N, Mohammadhashemi A, Alijani S, Rezazadeh Goli R, Ghanbari ...
Tamura K, Peterson D, Peterson N, Stecher G, Nei M, ...
نمایش کامل مراجع