سیویلیکا را در شبکه های اجتماعی دنبال نمایید.

آنالیز فیلوژنتیکی و تعیین ترادف ژن اینکلوژن بادی دو جدایه ایرانی ویروس خراشک حلقوی میخک

Publish Year: 1393
Type: Journal paper
Language: English
View: 290
این Paper فقط به صورت چکیده توسط دبیرخانه ارسال شده است و فایل کامل قابل دریافت نیست. برای یافتن Papers دارای فایل کامل، از بخش [جستجوی مقالات فارسی] اقدام فرمایید.

Export:

Link to this Paper:

Document National Code:

JR_JOAGK-6-2_001

Index date: 5 December 2020

آنالیز فیلوژنتیکی و تعیین ترادف ژن اینکلوژن بادی دو جدایه ایرانی ویروس خراشک حلقوی میخک abstract

ویروس خراشک حلقوی میخک (Carnation etched ring virus, CERV)، عضو جنس Caulimovirus و خانواده ی Caulimoviridae است. این ویروس به عنوان دومین ویروس مهم میخک پس از ویروس ابلقی میخک محسوب می شود. به منظور شناسایی ویروس مذکور، در طی بازدید از گلخانه­های میخک استانهای خراسان رضوی (مشهد) و مرکزی (محلات)، نمونه‌‌های مشکوک به آلودگی جمع‌آوری گردید. تشخیص اولیه CERV با استفاده از آزمون سرولوژیکی الایزای غیر مستقیم صورت گرفت. استخراج DNA از برگهای تازه نمونه­های آلوده، با استفاده از بافرCTAB  انجام شد. در آزمون PCR پس از به کار‌بردن جفت آغازگرهای اختصاصی قطعه ای به اندازه 1500 جفت‌ باز، واقع در ناحیه اینکلوژن بادی تکثیر شد. ترادف های بدست آمده، همراه با تعدادی از ترادف های کائولیموویروس های موجود در بانک ژن مقایسه شد. دندروگرام با استفاده از ترادف ژن اینکلوژن بادی با نرم افزار MEGA5 و به روش Neighbor joining ترسیم گردید. نتایج حاصل از آنالیزهای فیلوژنی نشان داد که جدایه محلات بیشترین نزدیکی را با جدایه هند (AJ853858) به میزان 4/99% دارد. از طرفی شباهت دو ایزوله ایرانی به یکدیگر 2/92% و با سایر جدایه های موجود در بانک ژن بین 90 تا 4/99% است. در بررسی تغییرات آمینواسیدی جدایه ها، بیشترین تغییرات در جدایه هلند مشاهده گردید. اگرچه تفاوت قابل ملاحظه ای به میزان 9/92-6/60% در سطح توالی های آمینواسیدی مربوط به ناحیه اینکلوژن بادی در بین کائولیموویروس­ها وجود داشت.

آنالیز فیلوژنتیکی و تعیین ترادف ژن اینکلوژن بادی دو جدایه ایرانی ویروس خراشک حلقوی میخک Keywords:

آنالیز فیلوژنتیکی , واکنش زنجیره ای پلیمراز , ویروس خراشک حلقوی میخک

آنالیز فیلوژنتیکی و تعیین ترادف ژن اینکلوژن بادی دو جدایه ایرانی ویروس خراشک حلقوی میخک authors

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
Ashnayi M, Jafarpour B, Malekzadeh Shafaroudi S, Mirshamsi A (2010). ...
Ashnayi M, Jafarpour B, Malekzadeh Shafaroudi S, Mirshamsi A, Heydarinia ...
Bayat H (2008). Serological detection and prevalence of some carnation ...
Buchen-Osmond C (2006). Carnation etched ring virus. Retrieved Novamber 7, ...
Chenault K D, Melcher U (1994). Phylogenetic relationships reveal recombination ...
Fujisawa I, Rubio-Huertos M, Matsui C (1971). Incorporation of thymidine-H ...
Hull R, Sadler J, Longstaff M (1986). The sequence of ...
Hull R, Donson J (1981). Physical mapping of the DNAs ...
Lawson R. H, Hearon S (1980). Carnation etched ring virus ...
Martin R R (1990). Serological methods for detection and identification ...
Nassaj Hoseini M, Shamsbakhsh M (2010). Phylogenetic analysis methods. Haghshenass ...
Raikhy G, Hallan V, Kulshrestha S, Ram R, Zaidi A ...
Rubio- Huertos M, Castro S (1972). Electron microscopy of the ...
Sanger M, Daubert S, Goodman R (1991). The regions of ...
Zhang Y P, Uyemoto J K, Kirkpatrick B C (1998). ...
نمایش کامل مراجع