استفاده از تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی برای شناسایی اهداف بالقوه پروتئینی در پاتوژن Pseudomonas syringae به‌منظور کنترل این پاتوژن
Publish place: New Cellular Biotechnology - Molecular، Vol: 8، Issue: 31
Publish Year: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 321
This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_NCMBJ-8-31_004
تاریخ نمایه سازی: 16 اسفند 1399
Abstract:
سابقه و هدف: شناسایی اهداف اختصاصی در هر پاتوژن برای جلوگیری از اثرهای سوءمصرف سموم شیمیایی ضروری است. در مطالعه حاضر، با استفاده از یک روش بیوانفورماتیکی مبتنی بر همولوژی، پروتئوم پاتوژن P. syringae با پروتئوم گیاه گوجه‌فرنگی و دیگر محصولهای کشاورزی میزبان آن مقایسه و تعدادی پروتئین بهعنوان اهداف بالقوه برای مبارزه در پاتوژن انتخاب شدند.
مواد و روش‌ها: پروتئوم پاتوژن با گیاهان میزبان مقایسه و پروتئین‌های غیرمشابه انتخاب شدند. این پروتئین‌ها با پروتئوم انسان و سایر موجودات غیرهدف مقایسه و پروتئین‌های غیرمشابه انتخاب و اهداف بالقوه تحت آنالیزهای کیفی مختلفی قرار گرفتند.
یافته‌ها: نتایج آنالیزها، 95 پروتئین را بهعنوان اهداف منحصر بفرد مشخص کرد. از مجموع پروتئین‌ها، 59 پروتئین در سیتوپلاسم، 15 پروتئین در غشاء داخلی، 17 پروتئین در فضای پریپلاسمیک، 3 پروتئین در غشاء خارجی و 1 پروتئین در خارج از سلول پاتوژن P.syringae تجمع پیدا می‌کردند.
نتیجه‌گیری: پروتئین‌های مشخص شده در این مطالعه، اهدافی بسیار مؤثر برای مبارزه بوده و هدف قرار دادن چنین پروتئین‌هایی می‌تواند بهطور مؤثری باعث کنترل پاتوژن P.syringae شود. همچنین طراحی و تولید مواد شیمیایی علیه این پروتئین‌های هدف، در کنار کنترل مؤثر این پاتوژن، می‌تواند طیف وسیعی از پاتوژن‌ها را کنترل کرده و از اثرهای مضر بر انسان، موجودات غیرهدف و محیط زیست جلوگیری کند.
Keywords:
Authors
کامران سمیعی
Faculty Members of Agriculture, Islamic Azad University kangavar branch, Kangavar, I.R. of Iran
سید محسن سهرابی
Young Researchers and Elite Club, Khorramabad Branch, Islamic Azad University, Khorramabad, Iran.