گزارش گونه های نوکاردیای جداسازی شده ازخاک، توسط تعیین توالی ژن ۱۶S rRNA، اصفهان، ایران
Publish place: Biological Journal of Microorganisms، Vol: 4، Issue: 16
Publish Year: 1394
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 317
This Paper With 11 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_BJM-4-16_005
Index date: 1 May 2021
گزارش گونه های نوکاردیای جداسازی شده ازخاک، توسط تعیین توالی ژن ۱۶S rRNA، اصفهان، ایران abstract
مقدمه: جنس نوکاردیا جزو اکتینومیستهای هوازی هستند که یک گروه بزرگ از باکتریهای ساکن خاک را شامل میشوند، که در جهان پخش شدهاند. در این مطالعه، با استفاده از آزمونهای تشخیصی رایج، مرسوم و مولکولی گوناگون، چندین ایزولههای نوکاردیا جداسازی و تشخیص داده شد. مواد و روش ها: در این پژوهش، برای جداسازی از خاک، روش Slip-buried و برای استخراج DNA، روش Microwave oven استفاده شد و در این روشها، سویه استاندارد DSM ۴۳۷۵۷ Nocardia asteroides استفاده شد. در ادامه، روش PCR با استفاده از پرایمرهای عمومی انجام شد. نتایج: با تحلیل اطلاعات فنوتیپی و مولکولی، بهویژه تعیین توالی ژن ۱۶S rRNA، ژنهای نوکاردیایهای جداسازی شده از خاک اصفهان، که در ادامه به آنها اشاره شده است، درپایگاه داده NCBI باAccession number مربوط به هر ژن ثبت شدند. نوکاردیاهای ثبت شده در NCBI: Nocardia cyriacigeorgica KC۵۷۷۱۵۱, Nocardia asteroides KC۵۷۷۱۵۲, Nocardia cummidelens KC۵۷۷۱۵۳, Nocardia asteroides KC۵۷۷۱۵۵, Nocardia asteroides KC۵۷۷۱۵۵, Nocardia coubleae KC۵۷۷۱۵۶ .. بحث و نتیجه گیری: در این پژوهش ۶ گونه نوکاردیا جداسازی و تشخیص داده شد، که برخی از این گونههای جداسازی شده از خاک ایران، اصفهان، در زمان جداسازی و تشخیص،گونههای جدیدی بودند. برای تشخیص بیشترگونههای مختلف نوکاردیا میتوان در مطالعات بعدی از تکثیر و تعیین توالی ژنهای دیگر این باکتری از جمله ITS,hsp۶۵ secA, rpoB و sod بهره گرفت.
گزارش گونه های نوکاردیای جداسازی شده ازخاک، توسط تعیین توالی ژن ۱۶S rRNA، اصفهان، ایران Keywords:
گزارش گونه های نوکاردیای جداسازی شده ازخاک، توسط تعیین توالی ژن ۱۶S rRNA، اصفهان، ایران authors
سمانه بوربور
دانشجوی دکترای تخصصی میکروبشناسی، دانشگاهعلوم پزشکی اصفهان، ایران
جمشید فقری
دانشیار میکروبشناسی، دانشگاهعلوم پزشکی اصفهان، ایران
شراره مقیم
دانشیار میکروبشناسی، دانشگاهعلوم پزشکی اصفهان، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :