واکاوی پروفایل بیان ریز RNA در غدد پستانی گاو به منظور شناسایی مسیرهای زیستی دخیل در تولید شیر
Publish place: Veterinary Research & Biological Products، Vol: 33، Issue: 3
Publish Year: 1399
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 327
This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_VTJ-33-3_006
Index date: 29 May 2021
واکاوی پروفایل بیان ریز RNA در غدد پستانی گاو به منظور شناسایی مسیرهای زیستی دخیل در تولید شیر abstract
هدف علم اصلاح نژاد بهبود ژنتیکی صفات تولیدی است که تاثیر شگرفی بر سودآوری واحدهای دامپروری دارند. یکی از این صفات تولید شیر است که شیر علاوه بر اینکه غذای کاملی است منبع تامین پروتئین و کلسیم در تغذیه انسان به شمار می رود. یک راهکار مناسب برا ی بهبود این صفت شناسایی ریزRNAهایی است که بر تولید و ترکیب شیر تاثیرگذار هستند. ریزRNAها قطعات تک رشته ای و کوتاه RNA با طولی حدود ۲۲ نوکلئوتید هستند که در تمام سلول ها و مایعات بدن مثل خون و شیر حضور دارند. در این مطالعه برای بررسی چگونگی اثر ریزRNA بر فرآیند تولید شیر داده های پروفایل بیان ریزRNA مربوط به بافت پستانی گاو از پایگاه داده ArrayExpress استخراج گردید. با نرم افزار GEO۲R آنالیز بیان داده ها انجام شد. سپس با استفاده از نرم افزار miRwalk و targetscan ژن های هدف ریزRNAها شناسایی شدند. بعد از شناسایی ژن های هدف از نرم افزار DAVID جهت انجام واکاوی هستی شناسی و شناسایی مسیرهای متابولیکی مرتبط با ژن های هدف استفاده شد. در نهایت رسم شبکه ژن های هدف و واکاوی شبکه ژنی با استفاده از نرم افزار Cytoscape انجام شد. در این مطالعه ۱۸ ریزRNA دارای fold change بالاتر از ۲ بوده و ۵ ریز RNA دارای fold change کمتر از ۲ شناسایی شد که کنترل کننده بیان ۹۳۶ ژن هدف می باشند. مهم ترین مسیرهای شناخته شده موثر بر فرآیند تولید شیر که ژن های شناسایی شده فوق در تنظیم فعالیت آن ها دخالت دارند عبارتند از مسیرهای سیگنالینگ: TGFB، WNT، MAPK، mTOR، PI۳k-Akt، انسولین و پرولاکتین. نتایج این بررسی می تواند اطلاعات تکمیلی برای درک ارتباط ژن های موثر و عملکردهای بیولوژیکی آن ها در فرآیند تولید شیر را فراهم آورد.
واکاوی پروفایل بیان ریز RNA در غدد پستانی گاو به منظور شناسایی مسیرهای زیستی دخیل در تولید شیر Keywords:
واکاوی پروفایل بیان ریز RNA در غدد پستانی گاو به منظور شناسایی مسیرهای زیستی دخیل در تولید شیر authors
سعیده اسکندری نسب
ژنتیک و اصلاح دام، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج
محمدرضا بحرینی بهزادی
ژنتیک و اصلاح دام، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج
زهرا رودباری
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه جیرفت
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :