Molecular Docking and Molecular Dynamics Studies of Ectoine Drug and Polyamidoamine/Ectoine Conjugates With the ۶twk Protein
Publish place: Iranian Journal of Analytical Chemistry، Vol: 8، Issue: 1
Publish Year: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: English
View: 164
This Paper With 7 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_IJAC-8-1_006
تاریخ نمایه سازی: 23 خرداد 1400
Abstract:
The interactions of ۶twk protein with Ectoine drug, Polyamidoamine (PAMAM) /Ectoine and histidine modified PAMAM/Ectoine were investigated using molecular docking and molecular dynamics simulation. Based on the results of molecular docking increasing of binding energy and the decreasing of inhibition constant of the compounds, increase their inhibitory activity. Protein stability in complex with these ligands was investigated using molecular dynamics simulation approach. Results molecular dynamics simulation displayed that histidine modified PAMAM/Ectoine with the lowest mean square displacement (MSD) is the better suitable to deliver the ectoine drug. This causes the most controlled/diffusion of ectoine drug molecule. So, histidine modified PAMAM/Ectoine conjugate can be introduced for further investigations on interaction of ectoine drug and ۶twk protein.
Authors
Nosrat Madadi Mahani
Department of Chemistry, Payame Noor University, ۱۹۳۹۵-۴۶۹۷ Tehran, Iran
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :