بررسی پلی مورفیسم ژنومی تریکوفیتون روبروم (Trichophyton rubrum) جداشده از منابع بالینی کراتینیزه با روش RAPD_PCR

مقدمه: درماتوفیتوزیس عارضه قارچی بافت های کراتینیزه پوست، مو و ناخن است که درنتیجه استقرار درماتوفیت در نسوج روی می دهد. اقدام به تایپینگ و افتراق زیرگونه ها و مطالعه ارتباط احتمالی گونه های خاص با اشکال بالینی جدایه تریکوفیتون، با استفاده از روش RAPD-PCR، با کمک پرایمرهای تصادفی است که ابزار سودمندی برای تیپ بندی و تمایز گونه های قارچی به شمار می رود. هدف از این پژوهش، بررسی پلی مورفیسم ژنومی تریکوفیتون روبروم جداشده از منابع کراتینیزه با روش RAPD_PCR است. مواد و روش ها: در این مطالعه، ۶۰ نمونه درماتوفیتوزیس از بیماران پوستی در سنین ۱۲ تا ۴۵ سال، از بیمارستان خاتم الانبیا استان تهران و بیمارستان قدس استان مرکزی جداسازی شدند. نمونه ها در محیط سابورو دکستروز آگار یا محیط میکروبیوتیک آگار تلقیح گردیدند. درمجموع، ۳۰ نمونه مثبت (+) به دست آمد. برای استخراج DNA تریکوفیتون روبروم، از کیت اختصاصی استفاده شد. آزمون PCR با استفاده از پرایمرهای اختصاصی صورت گرفت و از روش RAPD_ PCRبرای بررسی ژنومی آن ها استفاده گردید. بررسی پلی مورفیسم ژنوم، شاخص ژنتیکی ارزشمندی در ارزیابی ساختار ژنوم تریکوفیتون روبروم است. یافته های پژوهش: از غربالگری نمونه های بالینی آزمایشگاه که بر اساس ویژگی های مورفولوژیک، میکروسکوپی و تست های بیوشیمیایی تعیین هویت شدند، درمجموع ۳۰ جدایه تریکوفیتون روبروم جدا گردید. این سویه ها در ۹ گروه مجزا دسته بندی شد که هرکدام از سویه ها صفات فنوتیپی و ژنوتیپی مشترک دارند. در میان کلاسترهای مشخص شده، بیشترین فراوانی مربوط به کلاستر ۹ است که ۱۲ ایزوله با ویژگی های خویشاوندی مشترک را در برمی گیرد.  بحث و نتیجه گیری: بررسی پلی مورفیسم ژنومی تریکوفیتون روبروم جداشده از نمونه های درماتوفیتی افراد مبتلا به درماتوفیتوزیس در منطقه جغرافیایی تهران، با تکنیک RAPD_ PCR ، به وسیله پرایمر اختصاصی پرداخته شد که در این مطالعه، بعد مسافت و متغیر گروه سنی تاثیر بسزایی داشتند. تنوع ژنتیکی می تواند در انتقال و بیماری زایی تریکوفیتون روبروم نقش ویژه ای داشته باشد.

Keywords:

Dermatophytosis , Genomic polymorphism , Trichophyton rubrum , RAPD-PCR , تریکوفیتون روبروم , درماتوفیتوزیس , پلی مورفیسم ژنومی , RAPD_ PCR